Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.31■■■■■ 6.28
Sox12Q04890 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Sox12Q04890 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
Sox12Q04890 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
Sox12Q04890 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
Sox12Q04890 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
Sox12Q04890 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Sox12Q04890 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Sox12Q04890 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Sox12Q04890 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
Sox12Q04890 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Sox12Q04890 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Sox12Q04890 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Sox12Q04890 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Sox12Q04890 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
Sox12Q04890 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Sox12Q04890 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Sox12Q04890 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Sox12Q04890 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Sox12Q04890 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Sox12Q04890 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Sox12Q04890 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Sox12Q04890 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Sox12Q04890 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Sox12Q04890 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Sox12Q04890 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Sox12Q04890 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Sox12Q04890 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Sox12Q04890 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Sox12Q04890 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Sox12Q04890 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Sox12Q04890 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Sox12Q04890 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Sox12Q04890 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Sox12Q04890 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sox12Q04890 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Sox12Q04890 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Sox12Q04890 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sox12Q04890 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Sox12Q04890 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Sox12Q04890 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Sox12Q04890 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Sox12Q04890 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Sox12Q04890 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Sox12Q04890 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Sox12Q04890 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Sox12Q04890 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Sox12Q04890 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Sox12Q04890 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Sox12Q04890 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Sox12Q04890 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sox12Q04890 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Sox12Q04890 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Sox12Q04890 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sox12Q04890 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Sox12Q04890 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Sox12Q04890 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sox12Q04890 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Sox12Q04890 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Sox12Q04890 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Sox12Q04890 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Sox12Q04890 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Sox12Q04890 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Sox12Q04890 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sox12Q04890 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Sox12Q04890 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Sox12Q04890 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Sox12Q04890 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Sox12Q04890 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Sox12Q04890 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sox12Q04890 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sox12Q04890 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sox12Q04890 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Sox12Q04890 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Sox12Q04890 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Sox12Q04890 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Sox12Q04890 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Sox12Q04890 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Sox12Q04890 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sox12Q04890 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Sox12Q04890 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Sox12Q04890 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sox12Q04890 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Sox12Q04890 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Sox12Q04890 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Sox12Q04890 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sox12Q04890 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Sox12Q04890 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Sox12Q04890 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Sox12Q04890 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Sox12Q04890 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Sox12Q04890 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Sox12Q04890 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Sox12Q04890 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sox12Q04890 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Sox12Q04890 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Sox12Q04890 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Sox12Q04890 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Sox12Q04890 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Sox12Q04890 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms