Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56.44■■■■■ 6.63
Trak1Q6PD31 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
Trak1Q6PD31 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
Trak1Q6PD31 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49.25■■■■■ 5.47
Trak1Q6PD31 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.98■■■■■ 5.43
Trak1Q6PD31 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Trak1Q6PD31 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
Trak1Q6PD31 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Trak1Q6PD31 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Trak1Q6PD31 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
Trak1Q6PD31 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Trak1Q6PD31 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.06■■■■■ 5.12
Trak1Q6PD31 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Trak1Q6PD31 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
Trak1Q6PD31 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Trak1Q6PD31 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
Trak1Q6PD31 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
Trak1Q6PD31 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
Trak1Q6PD31 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Trak1Q6PD31 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Trak1Q6PD31 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Trak1Q6PD31 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Trak1Q6PD31 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Trak1Q6PD31 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Trak1Q6PD31 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
Trak1Q6PD31 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Trak1Q6PD31 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Trak1Q6PD31 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Trak1Q6PD31 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Trak1Q6PD31 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Trak1Q6PD31 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
Trak1Q6PD31 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Trak1Q6PD31 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
Trak1Q6PD31 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Trak1Q6PD31 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
Trak1Q6PD31 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Trak1Q6PD31 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Trak1Q6PD31 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Trak1Q6PD31 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Trak1Q6PD31 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Trak1Q6PD31 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Trak1Q6PD31 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Trak1Q6PD31 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Trak1Q6PD31 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Trak1Q6PD31 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Trak1Q6PD31 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
Trak1Q6PD31 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Trak1Q6PD31 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Trak1Q6PD31 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Trak1Q6PD31 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Trak1Q6PD31 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Trak1Q6PD31 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Trak1Q6PD31 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Trak1Q6PD31 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Trak1Q6PD31 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
Trak1Q6PD31 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Trak1Q6PD31 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Trak1Q6PD31 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Trak1Q6PD31 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Trak1Q6PD31 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
Trak1Q6PD31 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Trak1Q6PD31 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Trak1Q6PD31 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Trak1Q6PD31 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Trak1Q6PD31 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Trak1Q6PD31 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Trak1Q6PD31 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Trak1Q6PD31 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Trak1Q6PD31 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Trak1Q6PD31 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Trak1Q6PD31 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Trak1Q6PD31 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Trak1Q6PD31 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Trak1Q6PD31 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Trak1Q6PD31 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Trak1Q6PD31 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Trak1Q6PD31 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Trak1Q6PD31 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Trak1Q6PD31 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Trak1Q6PD31 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Trak1Q6PD31 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Trak1Q6PD31 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Trak1Q6PD31 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Trak1Q6PD31 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Trak1Q6PD31 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Trak1Q6PD31 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Trak1Q6PD31 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Trak1Q6PD31 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Trak1Q6PD31 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Trak1Q6PD31 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Trak1Q6PD31 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Trak1Q6PD31 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Trak1Q6PD31 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Trak1Q6PD31 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
Trak1Q6PD31 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Trak1Q6PD31 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Trak1Q6PD31 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Trak1Q6PD31 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Trak1Q6PD31 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Trak1Q6PD31 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms