Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z25

Ofd1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ofd1Q80Z25 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
Ofd1Q80Z25 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Ofd1Q80Z25 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ofd1Q80Z25 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Ofd1Q80Z25 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ofd1Q80Z25 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ofd1Q80Z25 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Ofd1Q80Z25 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ofd1Q80Z25 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
Ofd1Q80Z25 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ofd1Q80Z25 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ofd1Q80Z25 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Ofd1Q80Z25 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ofd1Q80Z25 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Ofd1Q80Z25 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ofd1Q80Z25 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Ofd1Q80Z25 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ofd1Q80Z25 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Ofd1Q80Z25 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Ofd1Q80Z25 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ofd1Q80Z25 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ofd1Q80Z25 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ofd1Q80Z25 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ofd1Q80Z25 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ofd1Q80Z25 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Ofd1Q80Z25 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ofd1Q80Z25 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Ofd1Q80Z25 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ofd1Q80Z25 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ofd1Q80Z25 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ofd1Q80Z25 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ofd1Q80Z25 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ofd1Q80Z25 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ofd1Q80Z25 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ofd1Q80Z25 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Ofd1Q80Z25 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ofd1Q80Z25 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ofd1Q80Z25 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ofd1Q80Z25 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ofd1Q80Z25 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ofd1Q80Z25 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ofd1Q80Z25 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ofd1Q80Z25 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ofd1Q80Z25 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ofd1Q80Z25 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Ofd1Q80Z25 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ofd1Q80Z25 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ofd1Q80Z25 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Ofd1Q80Z25 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ofd1Q80Z25 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ofd1Q80Z25 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ofd1Q80Z25 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ofd1Q80Z25 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ofd1Q80Z25 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ofd1Q80Z25 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ofd1Q80Z25 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Ofd1Q80Z25 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ofd1Q80Z25 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ofd1Q80Z25 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ofd1Q80Z25 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ofd1Q80Z25 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Ofd1Q80Z25 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ofd1Q80Z25 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ofd1Q80Z25 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ofd1Q80Z25 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ofd1Q80Z25 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ofd1Q80Z25 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ofd1Q80Z25 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ofd1Q80Z25 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ofd1Q80Z25 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ofd1Q80Z25 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ofd1Q80Z25 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ofd1Q80Z25 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ofd1Q80Z25 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ofd1Q80Z25 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ofd1Q80Z25 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ofd1Q80Z25 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ofd1Q80Z25 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ofd1Q80Z25 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ofd1Q80Z25 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ofd1Q80Z25 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ofd1Q80Z25 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Ofd1Q80Z25 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ofd1Q80Z25 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ofd1Q80Z25 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ofd1Q80Z25 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Ofd1Q80Z25 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ofd1Q80Z25 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ofd1Q80Z25 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ofd1Q80Z25 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ofd1Q80Z25 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ofd1Q80Z25 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ofd1Q80Z25 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ofd1Q80Z25 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ofd1Q80Z25 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ofd1Q80Z25 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ofd1Q80Z25 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ofd1Q80Z25 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ofd1Q80Z25 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ofd1Q80Z25 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms