Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC78.01■■■■■ 10.08
NacadQ5SWP3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC72.7■■■■■ 9.23
NacadQ5SWP3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71.28■■■■■ 9
NacadQ5SWP3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC68.28■■■■■ 8.52
NacadQ5SWP3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC67.22■■■■■ 8.35
NacadQ5SWP3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC66■■■■■ 8.16
NacadQ5SWP3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC65.76■■■■■ 8.12
NacadQ5SWP3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC65.57■■■■■ 8.09
NacadQ5SWP3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.39■■■■■ 8.06
NacadQ5SWP3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.37■■■■■ 8.06
NacadQ5SWP3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC64.95■■■■■ 7.99
NacadQ5SWP3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC63.85■■■■■ 7.81
NacadQ5SWP3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.29■■■■■ 7.72
NacadQ5SWP3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC63.22■■■■■ 7.71
NacadQ5SWP3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC63.21■■■■■ 7.71
NacadQ5SWP3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.83■■■■■ 7.65
NacadQ5SWP3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.7■■■■■ 7.63
NacadQ5SWP3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.21■■■■■ 7.55
NacadQ5SWP3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC62.06■■■■■ 7.53
NacadQ5SWP3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.97■■■■■ 7.51
NacadQ5SWP3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC61.92■■■■■ 7.5
NacadQ5SWP3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC61.92■■■■■ 7.5
NacadQ5SWP3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.96■■■■■ 7.35
NacadQ5SWP3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60.78■■■■■ 7.32
NacadQ5SWP3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.58■■■■■ 7.29
NacadQ5SWP3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.53■■■■■ 7.28
NacadQ5SWP3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC60.48■■■■■ 7.27
NacadQ5SWP3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.3■■■■■ 7.24
NacadQ5SWP3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.99■■■■■ 7.19
NacadQ5SWP3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC59.85■■■■■ 7.17
NacadQ5SWP3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.8■■■■■ 7.16
NacadQ5SWP3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC59.7■■■■■ 7.15
NacadQ5SWP3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC59.65■■■■■ 7.14
NacadQ5SWP3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC59.61■■■■■ 7.13
NacadQ5SWP3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59.28■■■■■ 7.08
NacadQ5SWP3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.21■■■■■ 7.07
NacadQ5SWP3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC59.1■■■■■ 7.05
NacadQ5SWP3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.1■■■■■ 7.05
NacadQ5SWP3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.03■■■■■ 7.04
NacadQ5SWP3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC58.94■■■■■ 7.03
NacadQ5SWP3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC58.93■■■■■ 7.02
NacadQ5SWP3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.9■■■■■ 7.02
NacadQ5SWP3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC58.81■■■■■ 7
NacadQ5SWP3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.73■■■■■ 6.99
NacadQ5SWP3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC58.71■■■■■ 6.99
NacadQ5SWP3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.64■■■■■ 6.98
NacadQ5SWP3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC58.6■■■■■ 6.97
NacadQ5SWP3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC58.52■■■■■ 6.96
NacadQ5SWP3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC58.31■■■■■ 6.92
NacadQ5SWP3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC58.27■■■■■ 6.92
NacadQ5SWP3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC58.2■■■■■ 6.91
NacadQ5SWP3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC58.19■■■■■ 6.91
NacadQ5SWP3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.03■■■■■ 6.88
NacadQ5SWP3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC57.88■■■■■ 6.86
NacadQ5SWP3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC57.86■■■■■ 6.85
NacadQ5SWP3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.86■■■■■ 6.85
NacadQ5SWP3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC57.7■■■■■ 6.83
NacadQ5SWP3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.67■■■■■ 6.82
NacadQ5SWP3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.46■■■■■ 6.79
NacadQ5SWP3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC57.4■■■■■ 6.78
NacadQ5SWP3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.32■■■■■ 6.77
NacadQ5SWP3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC57.28■■■■■ 6.76
NacadQ5SWP3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC57.19■■■■■ 6.75
NacadQ5SWP3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.06■■■■■ 6.73
NacadQ5SWP3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
NacadQ5SWP3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC57.03■■■■■ 6.72
NacadQ5SWP3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC57■■■■■ 6.72
NacadQ5SWP3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC56.82■■■■■ 6.69
NacadQ5SWP3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.71■■■■■ 6.67
NacadQ5SWP3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.67■■■■■ 6.66
NacadQ5SWP3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC56.65■■■■■ 6.66
NacadQ5SWP3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC56.61■■■■■ 6.65
NacadQ5SWP3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.47■■■■■ 6.63
NacadQ5SWP3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.44■■■■■ 6.62
NacadQ5SWP3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.43■■■■■ 6.62
NacadQ5SWP3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.42■■■■■ 6.62
NacadQ5SWP3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC56.34■■■■■ 6.61
NacadQ5SWP3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.18■■■■■ 6.58
NacadQ5SWP3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC56.15■■■■■ 6.58
NacadQ5SWP3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.1■■■■■ 6.57
NacadQ5SWP3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC55.87■■■■■ 6.53
NacadQ5SWP3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC55.82■■■■■ 6.53
NacadQ5SWP3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55.81■■■■■ 6.53
NacadQ5SWP3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC55.8■■■■■ 6.52
NacadQ5SWP3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC55.8■■■■■ 6.52
NacadQ5SWP3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
NacadQ5SWP3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.73■■■■■ 6.51
NacadQ5SWP3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC55.69■■■■■ 6.51
NacadQ5SWP3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC55.65■■■■■ 6.5
NacadQ5SWP3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC55.57■■■■■ 6.49
NacadQ5SWP3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC55.57■■■■■ 6.49
NacadQ5SWP3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.48
NacadQ5SWP3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.55■■■■■ 6.48
NacadQ5SWP3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.55■■■■■ 6.48
NacadQ5SWP3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.55■■■■■ 6.48
NacadQ5SWP3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.48■■■■■ 6.47
NacadQ5SWP3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC55.41■■■■■ 6.46
NacadQ5SWP3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC55.36■■■■■ 6.45
NacadQ5SWP3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
NacadQ5SWP3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms