Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGN5

Plin1, Perilipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plin1Q8CGN5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.81■■■■■ 5.72
Plin1Q8CGN5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Plin1Q8CGN5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Plin1Q8CGN5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Plin1Q8CGN5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
Plin1Q8CGN5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Plin1Q8CGN5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
Plin1Q8CGN5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Plin1Q8CGN5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Plin1Q8CGN5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Plin1Q8CGN5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Plin1Q8CGN5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Plin1Q8CGN5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Plin1Q8CGN5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Plin1Q8CGN5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Plin1Q8CGN5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Plin1Q8CGN5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Plin1Q8CGN5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Plin1Q8CGN5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Plin1Q8CGN5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Plin1Q8CGN5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Plin1Q8CGN5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Plin1Q8CGN5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Plin1Q8CGN5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Plin1Q8CGN5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Plin1Q8CGN5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Plin1Q8CGN5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Plin1Q8CGN5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Plin1Q8CGN5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Plin1Q8CGN5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Plin1Q8CGN5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Plin1Q8CGN5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Plin1Q8CGN5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Plin1Q8CGN5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Plin1Q8CGN5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Plin1Q8CGN5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Plin1Q8CGN5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Plin1Q8CGN5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Plin1Q8CGN5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Plin1Q8CGN5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Plin1Q8CGN5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Plin1Q8CGN5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Plin1Q8CGN5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Plin1Q8CGN5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Plin1Q8CGN5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Plin1Q8CGN5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Plin1Q8CGN5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Plin1Q8CGN5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Plin1Q8CGN5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Plin1Q8CGN5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Plin1Q8CGN5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Plin1Q8CGN5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Plin1Q8CGN5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Plin1Q8CGN5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Plin1Q8CGN5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Plin1Q8CGN5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Plin1Q8CGN5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Plin1Q8CGN5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Plin1Q8CGN5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Plin1Q8CGN5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Plin1Q8CGN5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Plin1Q8CGN5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Plin1Q8CGN5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Plin1Q8CGN5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Plin1Q8CGN5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Plin1Q8CGN5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Plin1Q8CGN5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Plin1Q8CGN5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Plin1Q8CGN5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Plin1Q8CGN5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Plin1Q8CGN5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Plin1Q8CGN5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
Plin1Q8CGN5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Plin1Q8CGN5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Plin1Q8CGN5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Plin1Q8CGN5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Plin1Q8CGN5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Plin1Q8CGN5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Plin1Q8CGN5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Plin1Q8CGN5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Plin1Q8CGN5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Plin1Q8CGN5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Plin1Q8CGN5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Plin1Q8CGN5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Plin1Q8CGN5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Plin1Q8CGN5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Plin1Q8CGN5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Plin1Q8CGN5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Plin1Q8CGN5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Plin1Q8CGN5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Plin1Q8CGN5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Plin1Q8CGN5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Plin1Q8CGN5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Plin1Q8CGN5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Plin1Q8CGN5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Plin1Q8CGN5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Plin1Q8CGN5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Plin1Q8CGN5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Plin1Q8CGN5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Plin1Q8CGN5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms