Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.77■■■■■ 6.36
Srpk2O54781 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
Srpk2O54781 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
Srpk2O54781 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.79■■■■■ 5.24
Srpk2O54781 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
Srpk2O54781 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
Srpk2O54781 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Srpk2O54781 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Srpk2O54781 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Srpk2O54781 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Srpk2O54781 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Srpk2O54781 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
Srpk2O54781 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Srpk2O54781 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Srpk2O54781 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Srpk2O54781 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
Srpk2O54781 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Srpk2O54781 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Srpk2O54781 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Srpk2O54781 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
Srpk2O54781 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Srpk2O54781 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Srpk2O54781 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Srpk2O54781 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Srpk2O54781 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Srpk2O54781 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Srpk2O54781 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Srpk2O54781 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Srpk2O54781 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Srpk2O54781 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
Srpk2O54781 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Srpk2O54781 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Srpk2O54781 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Srpk2O54781 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Srpk2O54781 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Srpk2O54781 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Srpk2O54781 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Srpk2O54781 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Srpk2O54781 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Srpk2O54781 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Srpk2O54781 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Srpk2O54781 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Srpk2O54781 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Srpk2O54781 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Srpk2O54781 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Srpk2O54781 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Srpk2O54781 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Srpk2O54781 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Srpk2O54781 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Srpk2O54781 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Srpk2O54781 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Srpk2O54781 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Srpk2O54781 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Srpk2O54781 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Srpk2O54781 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Srpk2O54781 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Srpk2O54781 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Srpk2O54781 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Srpk2O54781 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Srpk2O54781 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Srpk2O54781 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Srpk2O54781 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Srpk2O54781 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Srpk2O54781 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Srpk2O54781 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Srpk2O54781 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Srpk2O54781 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Srpk2O54781 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Srpk2O54781 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Srpk2O54781 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Srpk2O54781 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Srpk2O54781 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Srpk2O54781 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Srpk2O54781 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Srpk2O54781 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Srpk2O54781 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Srpk2O54781 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Srpk2O54781 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.07
Srpk2O54781 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Srpk2O54781 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Srpk2O54781 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Srpk2O54781 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Srpk2O54781 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Srpk2O54781 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Srpk2O54781 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Srpk2O54781 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Srpk2O54781 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Srpk2O54781 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Srpk2O54781 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Srpk2O54781 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Srpk2O54781 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Srpk2O54781 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Srpk2O54781 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Srpk2O54781 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Srpk2O54781 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
Srpk2O54781 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Srpk2O54781 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Srpk2O54781 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Srpk2O54781 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Srpk2O54781 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms