Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
Clstn1Q9EPL2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Clstn1Q9EPL2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Clstn1Q9EPL2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Clstn1Q9EPL2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Clstn1Q9EPL2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Clstn1Q9EPL2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Clstn1Q9EPL2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Clstn1Q9EPL2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Clstn1Q9EPL2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Clstn1Q9EPL2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Clstn1Q9EPL2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Clstn1Q9EPL2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Clstn1Q9EPL2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Clstn1Q9EPL2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Clstn1Q9EPL2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Clstn1Q9EPL2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Clstn1Q9EPL2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Clstn1Q9EPL2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Clstn1Q9EPL2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Clstn1Q9EPL2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Clstn1Q9EPL2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Clstn1Q9EPL2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Clstn1Q9EPL2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clstn1Q9EPL2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Clstn1Q9EPL2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clstn1Q9EPL2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Clstn1Q9EPL2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clstn1Q9EPL2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Clstn1Q9EPL2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Clstn1Q9EPL2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Clstn1Q9EPL2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Clstn1Q9EPL2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Clstn1Q9EPL2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clstn1Q9EPL2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clstn1Q9EPL2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Clstn1Q9EPL2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Clstn1Q9EPL2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Clstn1Q9EPL2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Clstn1Q9EPL2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Clstn1Q9EPL2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Clstn1Q9EPL2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Clstn1Q9EPL2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn1Q9EPL2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clstn1Q9EPL2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Clstn1Q9EPL2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clstn1Q9EPL2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Clstn1Q9EPL2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Clstn1Q9EPL2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clstn1Q9EPL2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clstn1Q9EPL2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clstn1Q9EPL2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Clstn1Q9EPL2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clstn1Q9EPL2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn1Q9EPL2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clstn1Q9EPL2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clstn1Q9EPL2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Clstn1Q9EPL2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Clstn1Q9EPL2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clstn1Q9EPL2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clstn1Q9EPL2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Clstn1Q9EPL2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Clstn1Q9EPL2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clstn1Q9EPL2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clstn1Q9EPL2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clstn1Q9EPL2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clstn1Q9EPL2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clstn1Q9EPL2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Clstn1Q9EPL2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clstn1Q9EPL2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Clstn1Q9EPL2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Clstn1Q9EPL2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Clstn1Q9EPL2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clstn1Q9EPL2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clstn1Q9EPL2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clstn1Q9EPL2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Clstn1Q9EPL2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clstn1Q9EPL2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Clstn1Q9EPL2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clstn1Q9EPL2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clstn1Q9EPL2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Clstn1Q9EPL2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clstn1Q9EPL2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clstn1Q9EPL2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clstn1Q9EPL2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clstn1Q9EPL2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Clstn1Q9EPL2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn1Q9EPL2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clstn1Q9EPL2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clstn1Q9EPL2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Clstn1Q9EPL2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Clstn1Q9EPL2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clstn1Q9EPL2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Clstn1Q9EPL2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clstn1Q9EPL2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms