Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
Apbb1Q9QXJ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Apbb1Q9QXJ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Apbb1Q9QXJ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Apbb1Q9QXJ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Apbb1Q9QXJ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Apbb1Q9QXJ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Apbb1Q9QXJ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Apbb1Q9QXJ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Apbb1Q9QXJ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Apbb1Q9QXJ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Apbb1Q9QXJ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Apbb1Q9QXJ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Apbb1Q9QXJ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Apbb1Q9QXJ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Apbb1Q9QXJ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Apbb1Q9QXJ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Apbb1Q9QXJ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Apbb1Q9QXJ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Apbb1Q9QXJ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Apbb1Q9QXJ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Apbb1Q9QXJ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Apbb1Q9QXJ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Apbb1Q9QXJ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Apbb1Q9QXJ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Apbb1Q9QXJ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Apbb1Q9QXJ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Apbb1Q9QXJ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Apbb1Q9QXJ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Apbb1Q9QXJ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Apbb1Q9QXJ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Apbb1Q9QXJ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Apbb1Q9QXJ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Apbb1Q9QXJ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Apbb1Q9QXJ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Apbb1Q9QXJ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Apbb1Q9QXJ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Apbb1Q9QXJ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Apbb1Q9QXJ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Apbb1Q9QXJ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Apbb1Q9QXJ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Apbb1Q9QXJ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Apbb1Q9QXJ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Apbb1Q9QXJ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Apbb1Q9QXJ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Apbb1Q9QXJ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Apbb1Q9QXJ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Apbb1Q9QXJ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Apbb1Q9QXJ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Apbb1Q9QXJ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Apbb1Q9QXJ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Apbb1Q9QXJ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Apbb1Q9QXJ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Apbb1Q9QXJ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Apbb1Q9QXJ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Apbb1Q9QXJ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Apbb1Q9QXJ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Apbb1Q9QXJ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Apbb1Q9QXJ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Apbb1Q9QXJ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Apbb1Q9QXJ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Apbb1Q9QXJ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Apbb1Q9QXJ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Apbb1Q9QXJ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Apbb1Q9QXJ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Apbb1Q9QXJ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Apbb1Q9QXJ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Apbb1Q9QXJ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Apbb1Q9QXJ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Apbb1Q9QXJ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Apbb1Q9QXJ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Apbb1Q9QXJ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Apbb1Q9QXJ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Apbb1Q9QXJ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Apbb1Q9QXJ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Apbb1Q9QXJ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Apbb1Q9QXJ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Apbb1Q9QXJ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Apbb1Q9QXJ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Apbb1Q9QXJ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Apbb1Q9QXJ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Apbb1Q9QXJ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Apbb1Q9QXJ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Apbb1Q9QXJ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Apbb1Q9QXJ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Apbb1Q9QXJ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Apbb1Q9QXJ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Apbb1Q9QXJ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms