Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
Irx6Q9ER75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Irx6Q9ER75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Irx6Q9ER75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Irx6Q9ER75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Irx6Q9ER75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Irx6Q9ER75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Irx6Q9ER75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Irx6Q9ER75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Irx6Q9ER75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Irx6Q9ER75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Irx6Q9ER75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Irx6Q9ER75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Irx6Q9ER75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Irx6Q9ER75 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Irx6Q9ER75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Irx6Q9ER75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Irx6Q9ER75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Irx6Q9ER75 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
Irx6Q9ER75 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Irx6Q9ER75 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Irx6Q9ER75 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Irx6Q9ER75 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Irx6Q9ER75 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Irx6Q9ER75 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Irx6Q9ER75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Irx6Q9ER75 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Irx6Q9ER75 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Irx6Q9ER75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Irx6Q9ER75 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Irx6Q9ER75 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Irx6Q9ER75 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Irx6Q9ER75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Irx6Q9ER75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Irx6Q9ER75 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Irx6Q9ER75 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Irx6Q9ER75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Irx6Q9ER75 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Irx6Q9ER75 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Irx6Q9ER75 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Irx6Q9ER75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Irx6Q9ER75 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Irx6Q9ER75 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Irx6Q9ER75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Irx6Q9ER75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Irx6Q9ER75 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Irx6Q9ER75 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Irx6Q9ER75 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Irx6Q9ER75 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Irx6Q9ER75 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Irx6Q9ER75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Irx6Q9ER75 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Irx6Q9ER75 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Irx6Q9ER75 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Irx6Q9ER75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Irx6Q9ER75 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Irx6Q9ER75 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Irx6Q9ER75 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Irx6Q9ER75 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Irx6Q9ER75 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Irx6Q9ER75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Irx6Q9ER75 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Irx6Q9ER75 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Irx6Q9ER75 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Irx6Q9ER75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Irx6Q9ER75 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Irx6Q9ER75 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Irx6Q9ER75 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Irx6Q9ER75 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Irx6Q9ER75 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Irx6Q9ER75 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Irx6Q9ER75 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Irx6Q9ER75 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Irx6Q9ER75 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Irx6Q9ER75 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Irx6Q9ER75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Irx6Q9ER75 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Irx6Q9ER75 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Irx6Q9ER75 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Irx6Q9ER75 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Irx6Q9ER75 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Irx6Q9ER75 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Irx6Q9ER75 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Irx6Q9ER75 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Irx6Q9ER75 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Irx6Q9ER75 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Irx6Q9ER75 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Irx6Q9ER75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Irx6Q9ER75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Irx6Q9ER75 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Irx6Q9ER75 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Irx6Q9ER75 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Irx6Q9ER75 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Irx6Q9ER75 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Irx6Q9ER75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Irx6Q9ER75 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Irx6Q9ER75 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms