Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6F0

Ifit1bl1, Interferon-induced protein with tetratricpeptide repeats 1B-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.79■■■■■ 6.36
Ifit1bl1D3Z6F0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
Ifit1bl1D3Z6F0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
Ifit1bl1D3Z6F0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
Ifit1bl1D3Z6F0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Ifit1bl1D3Z6F0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Ifit1bl1D3Z6F0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Ifit1bl1D3Z6F0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Ifit1bl1D3Z6F0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Ifit1bl1D3Z6F0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Ifit1bl1D3Z6F0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ifit1bl1D3Z6F0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Ifit1bl1D3Z6F0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
Ifit1bl1D3Z6F0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
Ifit1bl1D3Z6F0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Ifit1bl1D3Z6F0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Ifit1bl1D3Z6F0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Ifit1bl1D3Z6F0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Ifit1bl1D3Z6F0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Ifit1bl1D3Z6F0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Ifit1bl1D3Z6F0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ifit1bl1D3Z6F0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Ifit1bl1D3Z6F0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Ifit1bl1D3Z6F0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Ifit1bl1D3Z6F0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Ifit1bl1D3Z6F0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
Ifit1bl1D3Z6F0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
Ifit1bl1D3Z6F0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Ifit1bl1D3Z6F0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Ifit1bl1D3Z6F0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ifit1bl1D3Z6F0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Ifit1bl1D3Z6F0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Ifit1bl1D3Z6F0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ifit1bl1D3Z6F0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Ifit1bl1D3Z6F0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Ifit1bl1D3Z6F0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ifit1bl1D3Z6F0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Ifit1bl1D3Z6F0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ifit1bl1D3Z6F0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ifit1bl1D3Z6F0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Ifit1bl1D3Z6F0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Ifit1bl1D3Z6F0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ifit1bl1D3Z6F0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ifit1bl1D3Z6F0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ifit1bl1D3Z6F0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ifit1bl1D3Z6F0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ifit1bl1D3Z6F0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ifit1bl1D3Z6F0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ifit1bl1D3Z6F0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Ifit1bl1D3Z6F0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ifit1bl1D3Z6F0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Ifit1bl1D3Z6F0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Ifit1bl1D3Z6F0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ifit1bl1D3Z6F0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ifit1bl1D3Z6F0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ifit1bl1D3Z6F0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ifit1bl1D3Z6F0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ifit1bl1D3Z6F0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ifit1bl1D3Z6F0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Ifit1bl1D3Z6F0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ifit1bl1D3Z6F0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ifit1bl1D3Z6F0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ifit1bl1D3Z6F0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ifit1bl1D3Z6F0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ifit1bl1D3Z6F0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ifit1bl1D3Z6F0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
Ifit1bl1D3Z6F0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ifit1bl1D3Z6F0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Ifit1bl1D3Z6F0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ifit1bl1D3Z6F0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Ifit1bl1D3Z6F0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ifit1bl1D3Z6F0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ifit1bl1D3Z6F0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Ifit1bl1D3Z6F0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ifit1bl1D3Z6F0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ifit1bl1D3Z6F0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ifit1bl1D3Z6F0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Ifit1bl1D3Z6F0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ifit1bl1D3Z6F0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Ifit1bl1D3Z6F0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Ifit1bl1D3Z6F0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ifit1bl1D3Z6F0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Ifit1bl1D3Z6F0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ifit1bl1D3Z6F0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ifit1bl1D3Z6F0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ifit1bl1D3Z6F0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ifit1bl1D3Z6F0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ifit1bl1D3Z6F0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ifit1bl1D3Z6F0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms