Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.42■■■■■ 7.42
Aebp1Q640N1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.92■■■■■ 6.7
Aebp1Q640N1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.04■■■■■ 6.56
Aebp1Q640N1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.43■■■■■ 6.14
Aebp1Q640N1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53.36■■■■■ 6.13
Aebp1Q640N1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.24■■■■■ 5.95
Aebp1Q640N1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
Aebp1Q640N1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Aebp1Q640N1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
Aebp1Q640N1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.19■■■■■ 5.79
Aebp1Q640N1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
Aebp1Q640N1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
Aebp1Q640N1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
Aebp1Q640N1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
Aebp1Q640N1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.86■■■■■ 5.57
Aebp1Q640N1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.59■■■■■ 5.53
Aebp1Q640N1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.5■■■■■ 5.51
Aebp1Q640N1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.35■■■■■ 5.49
Aebp1Q640N1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
Aebp1Q640N1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
Aebp1Q640N1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
Aebp1Q640N1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
Aebp1Q640N1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.77■■■■■ 5.4
Aebp1Q640N1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
Aebp1Q640N1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Aebp1Q640N1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Aebp1Q640N1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Aebp1Q640N1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.63■■■■■ 5.38
Aebp1Q640N1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.35
Aebp1Q640N1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Aebp1Q640N1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Aebp1Q640N1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Aebp1Q640N1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Aebp1Q640N1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Aebp1Q640N1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
Aebp1Q640N1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Aebp1Q640N1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Aebp1Q640N1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Aebp1Q640N1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
Aebp1Q640N1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Aebp1Q640N1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Aebp1Q640N1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Aebp1Q640N1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
Aebp1Q640N1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
Aebp1Q640N1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
Aebp1Q640N1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
Aebp1Q640N1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
Aebp1Q640N1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Aebp1Q640N1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Aebp1Q640N1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
Aebp1Q640N1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
Aebp1Q640N1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Aebp1Q640N1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.94■■■■■ 4.94
Aebp1Q640N1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.94
Aebp1Q640N1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
Aebp1Q640N1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Aebp1Q640N1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Aebp1Q640N1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
Aebp1Q640N1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Aebp1Q640N1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Aebp1Q640N1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Aebp1Q640N1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Aebp1Q640N1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Aebp1Q640N1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Aebp1Q640N1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Aebp1Q640N1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Aebp1Q640N1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
Aebp1Q640N1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Aebp1Q640N1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Aebp1Q640N1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Aebp1Q640N1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Aebp1Q640N1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Aebp1Q640N1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
Aebp1Q640N1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Aebp1Q640N1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Aebp1Q640N1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Aebp1Q640N1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Aebp1Q640N1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Aebp1Q640N1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Aebp1Q640N1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Aebp1Q640N1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Aebp1Q640N1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Aebp1Q640N1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.86■■■■■ 4.77
Aebp1Q640N1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Aebp1Q640N1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Aebp1Q640N1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Aebp1Q640N1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Aebp1Q640N1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Aebp1Q640N1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Aebp1Q640N1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Aebp1Q640N1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Aebp1Q640N1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
Aebp1Q640N1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Aebp1Q640N1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Aebp1Q640N1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Aebp1Q640N1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Aebp1Q640N1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Aebp1Q640N1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Aebp1Q640N1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Aebp1Q640N1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms