Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63.05■■■■■ 7.68
Rpap1Q80TE0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58.63■■■■■ 6.98
Rpap1Q80TE0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.56■■■■■ 6.8
Rpap1Q80TE0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.99■■■■■ 6.39
Rpap1Q80TE0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.54■■■■■ 6.32
Rpap1Q80TE0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.35■■■■■ 6.13
Rpap1Q80TE0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
Rpap1Q80TE0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
Rpap1Q80TE0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
Rpap1Q80TE0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
Rpap1Q80TE0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.51■■■■■ 6
Rpap1Q80TE0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
Rpap1Q80TE0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51.44■■■■■ 5.82
Rpap1Q80TE0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
Rpap1Q80TE0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.99■■■■■ 5.75
Rpap1Q80TE0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.88■■■■■ 5.74
Rpap1Q80TE0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
Rpap1Q80TE0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
Rpap1Q80TE0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
Rpap1Q80TE0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.35■■■■■ 5.65
Rpap1Q80TE0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
Rpap1Q80TE0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
Rpap1Q80TE0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
Rpap1Q80TE0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
Rpap1Q80TE0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
Rpap1Q80TE0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
Rpap1Q80TE0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
Rpap1Q80TE0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
Rpap1Q80TE0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
Rpap1Q80TE0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Rpap1Q80TE0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
Rpap1Q80TE0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
Rpap1Q80TE0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
Rpap1Q80TE0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Rpap1Q80TE0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.65■■■■■ 5.38
Rpap1Q80TE0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.34
Rpap1Q80TE0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Rpap1Q80TE0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.32■■■■■ 5.33
Rpap1Q80TE0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48.22■■■■■ 5.31
Rpap1Q80TE0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.03■■■■■ 5.28
Rpap1Q80TE0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Rpap1Q80TE0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Rpap1Q80TE0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Rpap1Q80TE0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
Rpap1Q80TE0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
Rpap1Q80TE0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
Rpap1Q80TE0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Rpap1Q80TE0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.38■■■■■ 5.17
Rpap1Q80TE0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
Rpap1Q80TE0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Rpap1Q80TE0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Rpap1Q80TE0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
Rpap1Q80TE0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
Rpap1Q80TE0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
Rpap1Q80TE0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
Rpap1Q80TE0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Rpap1Q80TE0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
Rpap1Q80TE0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Rpap1Q80TE0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Rpap1Q80TE0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Rpap1Q80TE0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Rpap1Q80TE0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Rpap1Q80TE0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rpap1Q80TE0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rpap1Q80TE0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rpap1Q80TE0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
Rpap1Q80TE0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Rpap1Q80TE0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Rpap1Q80TE0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Rpap1Q80TE0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Rpap1Q80TE0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
Rpap1Q80TE0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Rpap1Q80TE0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Rpap1Q80TE0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
Rpap1Q80TE0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Rpap1Q80TE0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Rpap1Q80TE0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
Rpap1Q80TE0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Rpap1Q80TE0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Rpap1Q80TE0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Rpap1Q80TE0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Rpap1Q80TE0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Rpap1Q80TE0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
Rpap1Q80TE0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Rpap1Q80TE0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Rpap1Q80TE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Rpap1Q80TE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Rpap1Q80TE0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Rpap1Q80TE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Rpap1Q80TE0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Rpap1Q80TE0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Rpap1Q80TE0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Rpap1Q80TE0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Rpap1Q80TE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Rpap1Q80TE0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
Rpap1Q80TE0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Rpap1Q80TE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Rpap1Q80TE0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Rpap1Q80TE0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Rpap1Q80TE0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms