Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Plcb2A3KGF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Plcb2A3KGF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Plcb2A3KGF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Plcb2A3KGF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Plcb2A3KGF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Plcb2A3KGF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Plcb2A3KGF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Plcb2A3KGF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Plcb2A3KGF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Plcb2A3KGF7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Plcb2A3KGF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Plcb2A3KGF7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Plcb2A3KGF7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Plcb2A3KGF7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Plcb2A3KGF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Plcb2A3KGF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Plcb2A3KGF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Plcb2A3KGF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Plcb2A3KGF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Plcb2A3KGF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Plcb2A3KGF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Plcb2A3KGF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Plcb2A3KGF7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Plcb2A3KGF7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Plcb2A3KGF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Plcb2A3KGF7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Plcb2A3KGF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Plcb2A3KGF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Plcb2A3KGF7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Plcb2A3KGF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Plcb2A3KGF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Plcb2A3KGF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Plcb2A3KGF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Plcb2A3KGF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Plcb2A3KGF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Plcb2A3KGF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Plcb2A3KGF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Plcb2A3KGF7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Plcb2A3KGF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Plcb2A3KGF7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Plcb2A3KGF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Plcb2A3KGF7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Plcb2A3KGF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Plcb2A3KGF7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Plcb2A3KGF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Plcb2A3KGF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Plcb2A3KGF7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Plcb2A3KGF7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Plcb2A3KGF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Plcb2A3KGF7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Plcb2A3KGF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Plcb2A3KGF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Plcb2A3KGF7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Plcb2A3KGF7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Plcb2A3KGF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Plcb2A3KGF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Plcb2A3KGF7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Plcb2A3KGF7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Plcb2A3KGF7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Plcb2A3KGF7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Plcb2A3KGF7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Plcb2A3KGF7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Plcb2A3KGF7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Plcb2A3KGF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Plcb2A3KGF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Plcb2A3KGF7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Plcb2A3KGF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Plcb2A3KGF7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Plcb2A3KGF7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Plcb2A3KGF7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Plcb2A3KGF7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Plcb2A3KGF7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Plcb2A3KGF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Plcb2A3KGF7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Plcb2A3KGF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Plcb2A3KGF7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Plcb2A3KGF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Plcb2A3KGF7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Plcb2A3KGF7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Plcb2A3KGF7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Plcb2A3KGF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Plcb2A3KGF7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Plcb2A3KGF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Plcb2A3KGF7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Plcb2A3KGF7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Plcb2A3KGF7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Plcb2A3KGF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Plcb2A3KGF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Plcb2A3KGF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Plcb2A3KGF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Plcb2A3KGF7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Plcb2A3KGF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Plcb2A3KGF7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Plcb2A3KGF7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Plcb2A3KGF7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Plcb2A3KGF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Plcb2A3KGF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Plcb2A3KGF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Plcb2A3KGF7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms