Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Trim44Q9QXA7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Trim44Q9QXA7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Trim44Q9QXA7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Trim44Q9QXA7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim44Q9QXA7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Trim44Q9QXA7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Trim44Q9QXA7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim44Q9QXA7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim44Q9QXA7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trim44Q9QXA7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim44Q9QXA7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim44Q9QXA7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trim44Q9QXA7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trim44Q9QXA7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trim44Q9QXA7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trim44Q9QXA7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Trim44Q9QXA7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim44Q9QXA7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trim44Q9QXA7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trim44Q9QXA7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Trim44Q9QXA7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim44Q9QXA7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim44Q9QXA7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim44Q9QXA7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Trim44Q9QXA7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim44Q9QXA7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim44Q9QXA7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim44Q9QXA7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim44Q9QXA7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim44Q9QXA7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim44Q9QXA7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trim44Q9QXA7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim44Q9QXA7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim44Q9QXA7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim44Q9QXA7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trim44Q9QXA7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trim44Q9QXA7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim44Q9QXA7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trim44Q9QXA7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim44Q9QXA7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim44Q9QXA7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim44Q9QXA7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim44Q9QXA7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim44Q9QXA7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trim44Q9QXA7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trim44Q9QXA7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim44Q9QXA7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trim44Q9QXA7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Trim44Q9QXA7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Trim44Q9QXA7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Trim44Q9QXA7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trim44Q9QXA7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim44Q9QXA7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim44Q9QXA7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim44Q9QXA7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim44Q9QXA7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim44Q9QXA7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim44Q9QXA7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim44Q9QXA7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim44Q9QXA7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim44Q9QXA7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim44Q9QXA7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim44Q9QXA7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim44Q9QXA7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trim44Q9QXA7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Trim44Q9QXA7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trim44Q9QXA7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trim44Q9QXA7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trim44Q9QXA7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim44Q9QXA7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim44Q9QXA7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trim44Q9QXA7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trim44Q9QXA7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim44Q9QXA7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trim44Q9QXA7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Trim44Q9QXA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trim44Q9QXA7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trim44Q9QXA7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trim44Q9QXA7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trim44Q9QXA7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trim44Q9QXA7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Trim44Q9QXA7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Trim44Q9QXA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trim44Q9QXA7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trim44Q9QXA7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trim44Q9QXA7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Trim44Q9QXA7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim44Q9QXA7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trim44Q9QXA7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trim44Q9QXA7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trim44Q9QXA7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trim44Q9QXA7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trim44Q9QXA7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trim44Q9QXA7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trim44Q9QXA7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trim44Q9QXA7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trim44Q9QXA7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms