Protein–RNA interactions for Protein: O88735

Map7, Ensconsin, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map7O88735 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Map7O88735 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Map7O88735 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Map7O88735 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Map7O88735 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Map7O88735 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Map7O88735 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Map7O88735 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Map7O88735 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Map7O88735 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Map7O88735 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Map7O88735 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Map7O88735 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Map7O88735 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Map7O88735 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Map7O88735 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Map7O88735 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Map7O88735 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Map7O88735 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Map7O88735 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Map7O88735 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Map7O88735 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Map7O88735 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Map7O88735 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Map7O88735 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Map7O88735 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Map7O88735 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Map7O88735 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Map7O88735 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Map7O88735 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Map7O88735 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Map7O88735 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Map7O88735 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Map7O88735 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Map7O88735 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Map7O88735 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Map7O88735 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Map7O88735 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Map7O88735 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Map7O88735 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Map7O88735 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Map7O88735 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Map7O88735 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Map7O88735 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Map7O88735 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Map7O88735 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Map7O88735 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Map7O88735 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Map7O88735 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Map7O88735 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Map7O88735 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Map7O88735 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Map7O88735 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Map7O88735 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Map7O88735 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Map7O88735 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Map7O88735 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Map7O88735 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map7O88735 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Map7O88735 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Map7O88735 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Map7O88735 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Map7O88735 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Map7O88735 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Map7O88735 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Map7O88735 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Map7O88735 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Map7O88735 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Map7O88735 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Map7O88735 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Map7O88735 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Map7O88735 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Map7O88735 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Map7O88735 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Map7O88735 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map7O88735 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Map7O88735 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Map7O88735 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Map7O88735 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Map7O88735 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Map7O88735 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Map7O88735 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Map7O88735 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Map7O88735 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Map7O88735 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Map7O88735 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Map7O88735 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Map7O88735 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map7O88735 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map7O88735 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Map7O88735 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Map7O88735 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Map7O88735 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Map7O88735 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Map7O88735 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map7O88735 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map7O88735 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Map7O88735 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Map7O88735 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Map7O88735 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms