Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N8

CDH10, Cadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH10Q9Y6N8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDH10Q9Y6N8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDH10Q9Y6N8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDH10Q9Y6N8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDH10Q9Y6N8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CDH10Q9Y6N8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDH10Q9Y6N8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDH10Q9Y6N8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDH10Q9Y6N8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDH10Q9Y6N8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDH10Q9Y6N8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDH10Q9Y6N8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDH10Q9Y6N8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDH10Q9Y6N8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH10Q9Y6N8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH10Q9Y6N8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH10Q9Y6N8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH10Q9Y6N8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH10Q9Y6N8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH10Q9Y6N8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH10Q9Y6N8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDH10Q9Y6N8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH10Q9Y6N8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH10Q9Y6N8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH10Q9Y6N8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH10Q9Y6N8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH10Q9Y6N8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDH10Q9Y6N8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH10Q9Y6N8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH10Q9Y6N8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH10Q9Y6N8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH10Q9Y6N8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH10Q9Y6N8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH10Q9Y6N8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH10Q9Y6N8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH10Q9Y6N8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH10Q9Y6N8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH10Q9Y6N8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDH10Q9Y6N8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH10Q9Y6N8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH10Q9Y6N8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH10Q9Y6N8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH10Q9Y6N8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH10Q9Y6N8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH10Q9Y6N8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH10Q9Y6N8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH10Q9Y6N8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH10Q9Y6N8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH10Q9Y6N8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH10Q9Y6N8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH10Q9Y6N8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH10Q9Y6N8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH10Q9Y6N8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH10Q9Y6N8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH10Q9Y6N8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH10Q9Y6N8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH10Q9Y6N8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH10Q9Y6N8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH10Q9Y6N8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH10Q9Y6N8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH10Q9Y6N8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH10Q9Y6N8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH10Q9Y6N8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH10Q9Y6N8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH10Q9Y6N8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH10Q9Y6N8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH10Q9Y6N8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH10Q9Y6N8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH10Q9Y6N8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH10Q9Y6N8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH10Q9Y6N8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH10Q9Y6N8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH10Q9Y6N8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH10Q9Y6N8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH10Q9Y6N8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH10Q9Y6N8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH10Q9Y6N8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH10Q9Y6N8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH10Q9Y6N8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH10Q9Y6N8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH10Q9Y6N8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH10Q9Y6N8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH10Q9Y6N8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH10Q9Y6N8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH10Q9Y6N8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH10Q9Y6N8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH10Q9Y6N8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH10Q9Y6N8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH10Q9Y6N8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH10Q9Y6N8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH10Q9Y6N8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH10Q9Y6N8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH10Q9Y6N8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH10Q9Y6N8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH10Q9Y6N8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH10Q9Y6N8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH10Q9Y6N8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH10Q9Y6N8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH10Q9Y6N8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH10Q9Y6N8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms