Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCD2Q9UBJ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ABCD2Q9UBJ2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ABCD2Q9UBJ2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ABCD2Q9UBJ2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCD2Q9UBJ2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCD2Q9UBJ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCD2Q9UBJ2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCD2Q9UBJ2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCD2Q9UBJ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCD2Q9UBJ2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCD2Q9UBJ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCD2Q9UBJ2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCD2Q9UBJ2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCD2Q9UBJ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCD2Q9UBJ2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCD2Q9UBJ2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCD2Q9UBJ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCD2Q9UBJ2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCD2Q9UBJ2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCD2Q9UBJ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCD2Q9UBJ2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCD2Q9UBJ2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCD2Q9UBJ2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCD2Q9UBJ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCD2Q9UBJ2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCD2Q9UBJ2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCD2Q9UBJ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCD2Q9UBJ2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCD2Q9UBJ2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCD2Q9UBJ2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCD2Q9UBJ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCD2Q9UBJ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCD2Q9UBJ2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCD2Q9UBJ2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCD2Q9UBJ2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCD2Q9UBJ2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCD2Q9UBJ2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCD2Q9UBJ2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCD2Q9UBJ2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCD2Q9UBJ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCD2Q9UBJ2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCD2Q9UBJ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCD2Q9UBJ2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCD2Q9UBJ2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCD2Q9UBJ2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCD2Q9UBJ2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCD2Q9UBJ2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD2Q9UBJ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCD2Q9UBJ2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCD2Q9UBJ2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCD2Q9UBJ2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCD2Q9UBJ2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCD2Q9UBJ2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCD2Q9UBJ2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCD2Q9UBJ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCD2Q9UBJ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCD2Q9UBJ2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCD2Q9UBJ2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCD2Q9UBJ2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCD2Q9UBJ2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCD2Q9UBJ2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCD2Q9UBJ2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCD2Q9UBJ2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCD2Q9UBJ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCD2Q9UBJ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCD2Q9UBJ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCD2Q9UBJ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCD2Q9UBJ2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCD2Q9UBJ2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCD2Q9UBJ2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD2Q9UBJ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD2Q9UBJ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD2Q9UBJ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD2Q9UBJ2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD2Q9UBJ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCD2Q9UBJ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD2Q9UBJ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCD2Q9UBJ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCD2Q9UBJ2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD2Q9UBJ2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD2Q9UBJ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms