Protein–RNA interactions for Protein: Q9H165

BCL11A, B-cell lymphoma/leukemia 11A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11AQ9H165 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BCL11AQ9H165 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BCL11AQ9H165 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BCL11AQ9H165 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BCL11AQ9H165 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BCL11AQ9H165 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BCL11AQ9H165 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BCL11AQ9H165 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
BCL11AQ9H165 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
BCL11AQ9H165 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
BCL11AQ9H165 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
BCL11AQ9H165 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
BCL11AQ9H165 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BCL11AQ9H165 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BCL11AQ9H165 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BCL11AQ9H165 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BCL11AQ9H165 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BCL11AQ9H165 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BCL11AQ9H165 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BCL11AQ9H165 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BCL11AQ9H165 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BCL11AQ9H165 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCL11AQ9H165 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCL11AQ9H165 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BCL11AQ9H165 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BCL11AQ9H165 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BCL11AQ9H165 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BCL11AQ9H165 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BCL11AQ9H165 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BCL11AQ9H165 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BCL11AQ9H165 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BCL11AQ9H165 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BCL11AQ9H165 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BCL11AQ9H165 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BCL11AQ9H165 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BCL11AQ9H165 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BCL11AQ9H165 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BCL11AQ9H165 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
BCL11AQ9H165 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BCL11AQ9H165 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCL11AQ9H165 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCL11AQ9H165 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCL11AQ9H165 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCL11AQ9H165 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCL11AQ9H165 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
BCL11AQ9H165 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BCL11AQ9H165 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
BCL11AQ9H165 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
BCL11AQ9H165 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BCL11AQ9H165 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCL11AQ9H165 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCL11AQ9H165 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BCL11AQ9H165 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
BCL11AQ9H165 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCL11AQ9H165 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BCL11AQ9H165 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BCL11AQ9H165 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BCL11AQ9H165 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BCL11AQ9H165 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
BCL11AQ9H165 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BCL11AQ9H165 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCL11AQ9H165 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCL11AQ9H165 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
BCL11AQ9H165 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BCL11AQ9H165 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BCL11AQ9H165 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BCL11AQ9H165 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BCL11AQ9H165 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BCL11AQ9H165 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BCL11AQ9H165 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BCL11AQ9H165 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCL11AQ9H165 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCL11AQ9H165 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BCL11AQ9H165 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BCL11AQ9H165 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms