Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ67

GRWD1, Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRWD1Q9BQ67 MLEC-203ENST00000535413 617 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-11■■■■■ 49.4
GRWD1Q9BQ67 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC8.64□□□□□ -1.035e-15■■■■■ 49
GRWD1Q9BQ67 POLR2A-202ENST00000573603 648 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-15■■■■■ 48.7
GRWD1Q9BQ67 ELP2-218ENST00000541748 674 ntTSL 221.92■■□□□ 1.12e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 ELP2-227ENST00000545302 635 ntTSL 220.79■□□□□ 0.922e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 ELP2-209ENST00000536830 636 ntTSL 220.34■□□□□ 0.852e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 ELP2-226ENST00000544274 414 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 319.27■□□□□ 0.682e-14■■■■■ 45.7
GRWD1Q9BQ67 ANKRD17-209ENST00000560507 563 ntTSL 314.12□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 45.4
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.431e-11■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 218.41■□□□□ 0.541e-11■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-13■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 43.6
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 218.79■□□□□ 0.63e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.243e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-205ENST00000518876 3968 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.043e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 DNAJC21-203ENST00000506762 402 ntTSL 213.98□□□□□ -0.179e-9■■■■■ 42.6
GRWD1Q9BQ67 DNAJC21-205ENST00000512136 2516 ntTSL 212.4□□□□□ -0.429e-9■■■■■ 42.6
GRWD1Q9BQ67 CCDC12-206ENST00000492819 853 ntTSL 526.56■■□□□ 1.848e-12■■■■■ 42.1
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-202ENST00000398676 565 ntTSL 322.2■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 41.9
GRWD1Q9BQ67 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 41.5
GRWD1Q9BQ67 CALD1-218ENST00000478075 193 ntTSL 314.58□□□□□ -0.082e-16■■■■■ 40.8
GRWD1Q9BQ67 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 225.93■■□□□ 1.744e-13■■■■■ 40.8
GRWD1Q9BQ67 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.244e-13■■■■■ 40.8
GRWD1Q9BQ67 RPA3-207ENST00000483031 641 ntTSL 216.61■□□□□ 0.254e-11■■■■■ 40.3
GRWD1Q9BQ67 GALT-229ENST00000605275 678 ntTSL 326.89■■□□□ 1.96e-13■■■■■ 40.2
GRWD1Q9BQ67 DNAJC2-205ENST00000426036 729 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 39.6
GRWD1Q9BQ67 LDHB-205ENST00000470280 710 ntTSL 216.13■□□□□ 0.175e-9■■■■■ 39.5
GRWD1Q9BQ67 LDHB-204ENST00000450584 732 ntTSL 314.49□□□□□ -0.095e-9■■■■■ 39.5
GRWD1Q9BQ67 LDHB-202ENST00000396075 744 ntTSL 312.98□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 39.5
GRWD1Q9BQ67 LIG1-216ENST00000598938 377 ntTSL 327.31■■□□□ 1.961e-10■■■■■ 39.4
GRWD1Q9BQ67 ACBD3-202ENST00000464927 294 ntTSL 26.51□□□□□ -1.372e-23■■■■■ 39.3
GRWD1Q9BQ67 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.752e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.912e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.522e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-206ENST00000481947 1260 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-205ENST00000466183 1130 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-205ENST00000614292 820 ntTSL 1 (best)30.16■■■□□ 2.427e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.737e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-209ENST00000639181 1534 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.37e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-204ENST00000613452 1050 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.027e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-210ENST00000640832 1709 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.367e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.17e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 NUP160-207ENST00000528501 1961 ntTSL 225.16■■□□□ 1.623e-8■■■■■ 38.9
GRWD1Q9BQ67 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 515.79■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 38.9
GRWD1Q9BQ67 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 219.94■□□□□ 0.784e-19■■■■■ 38.6
GRWD1Q9BQ67 SYAP1-202ENST00000495743 604 ntTSL 222■■□□□ 1.114e-10■■■■■ 38.5
GRWD1Q9BQ67 LIG1-208ENST00000595758 606 ntTSL 421.68■■□□□ 1.064e-12■■■■■ 38.4
GRWD1Q9BQ67 LIG1-209ENST00000596104 531 ntTSL 315.7■□□□□ 0.14e-12■■■■■ 38.4
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-201ENST00000368590 857 ntTSL 531.11■■■□□ 2.572e-10■■■■■ 38.3
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-206ENST00000518117 581 ntTSL 313.8□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 38.3
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-205ENST00000517800 446 ntTSL 312.26□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 38.3
GRWD1Q9BQ67 MARK3-219ENST00000559328 533 ntTSL 430.78■■■□□ 2.526e-23■■■■■ 38.1
GRWD1Q9BQ67 MARK3-221ENST00000560603 572 ntTSL 418.91■□□□□ 0.626e-23■■■■■ 38.1
GRWD1Q9BQ67 MARK3-225ENST00000561225 523 ntTSL 515.87■□□□□ 0.136e-23■■■■■ 38.1
GRWD1Q9BQ67 NSMCE4A-203ENST00000459911 541 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-13■■■■■ 37.8
GRWD1Q9BQ67 NSMCE4A-208ENST00000477289 643 ntTSL 215.03■□□□□ -03e-13■■■■■ 37.8
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-210ENST00000539250 701 ntTSL 215.46■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 37.7
GRWD1Q9BQ67 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.983e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 CYCS-204ENST00000413447 498 ntTSL 319.34■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 ARHGEF10L-207ENST00000482359 604 ntTSL 522.77■■□□□ 1.245e-10■■■■■ 37.4
GRWD1Q9BQ67 EXOC4-222ENST00000492326 549 ntTSL 412.04□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 37.2
GRWD1Q9BQ67 PALMD-202ENST00000496843 5294 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.421e-11■■■■■ 37.2
GRWD1Q9BQ67 SORBS3-213ENST00000522037 718 ntTSL 322.72■■□□□ 1.236e-8■■■■■ 37.1
GRWD1Q9BQ67 SPCS3-204ENST00000513139 589 ntTSL 221.99■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 37
GRWD1Q9BQ67 GALNT12-202ENST00000470473 772 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 37
GRWD1Q9BQ67 POLG-224ENST00000637711 142 ntTSL 526.39■■□□□ 1.821e-11■■■■■ 36.7
GRWD1Q9BQ67 POLG-219ENST00000636937 100 ntTSL 57.73□□□□□ -1.171e-11■■■■■ 36.7
GRWD1Q9BQ67 CHAF1A-205ENST00000587580 494 ntTSL 335.93■■■■□ 3.341e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 CHAF1A-203ENST00000585854 499 ntTSL 231.88■■■□□ 2.691e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 FAM208B-202ENST00000380270 738 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 FAM208B-212ENST00000532080 485 ntTSL 212.27□□□□□ -0.451e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-10■■■■■ 36.4
GRWD1Q9BQ67 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 227.3■■□□□ 1.962e-11■■■■■ 36.1
GRWD1Q9BQ67 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 526.39■■□□□ 1.822e-11■■■■■ 36.1
GRWD1Q9BQ67 KIAA0895L-203ENST00000561679 2824 ntTSL 221.89■■□□□ 1.12e-11■■■■■ 36.1
GRWD1Q9BQ67 MIB2-212ENST00000486072 568 ntTSL 333.13■■■□□ 2.891e-8■■■■■ 36
GRWD1Q9BQ67 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 413.87□□□□□ -0.194e-19■■■■■ 36
GRWD1Q9BQ67 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 518.75■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 35.7
GRWD1Q9BQ67 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 518.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 35.7
GRWD1Q9BQ67 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 315.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 35.7
GRWD1Q9BQ67 FGFR1OP2-203ENST00000395941 865 ntTSL 229.92■■■□□ 2.383e-6■■■■■ 35.5
GRWD1Q9BQ67 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 35.5
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 DDX10-202ENST00000524979 794 ntTSL 315.51■□□□□ 0.073e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 DDX10-206ENST00000534221 870 ntTSL 214.88□□□□□ -0.033e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-9■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 35.3
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