Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ67

GRWD1, Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRWD1Q9BQ67 MLEC-203ENST00000535413 617 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-11■■■■■ 49.4
GRWD1Q9BQ67 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC8.64□□□□□ -1.035e-15■■■■■ 49
GRWD1Q9BQ67 POLR2A-202ENST00000573603 648 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-15■■■■■ 48.7
GRWD1Q9BQ67 ELP2-218ENST00000541748 674 ntTSL 221.92■■□□□ 1.12e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 ELP2-227ENST00000545302 635 ntTSL 220.79■□□□□ 0.922e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 ELP2-209ENST00000536830 636 ntTSL 220.34■□□□□ 0.852e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 ELP2-226ENST00000544274 414 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 45.9
GRWD1Q9BQ67 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 319.27■□□□□ 0.682e-14■■■■■ 45.7
GRWD1Q9BQ67 ANKRD17-209ENST00000560507 563 ntTSL 314.12□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 45.4
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.431e-11■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 218.41■□□□□ 0.541e-11■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-13■■■■■ 44.5
GRWD1Q9BQ67 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 43.6
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 218.79■□□□□ 0.63e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.243e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 UQCRB-205ENST00000518876 3968 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.043e-26■■■■■ 43.5
GRWD1Q9BQ67 DNAJC21-203ENST00000506762 402 ntTSL 213.98□□□□□ -0.179e-9■■■■■ 42.6
GRWD1Q9BQ67 DNAJC21-205ENST00000512136 2516 ntTSL 212.4□□□□□ -0.429e-9■■■■■ 42.6
GRWD1Q9BQ67 CCDC12-206ENST00000492819 853 ntTSL 526.56■■□□□ 1.848e-12■■■■■ 42.1
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-202ENST00000398676 565 ntTSL 322.2■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 41.9
GRWD1Q9BQ67 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 41.5
GRWD1Q9BQ67 CALD1-218ENST00000478075 193 ntTSL 314.58□□□□□ -0.082e-16■■■■■ 40.8
GRWD1Q9BQ67 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 225.93■■□□□ 1.744e-13■■■■■ 40.8
GRWD1Q9BQ67 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.244e-13■■■■■ 40.8
GRWD1Q9BQ67 RPA3-207ENST00000483031 641 ntTSL 216.61■□□□□ 0.254e-11■■■■■ 40.3
GRWD1Q9BQ67 GALT-229ENST00000605275 678 ntTSL 326.89■■□□□ 1.96e-13■■■■■ 40.2
GRWD1Q9BQ67 DNAJC2-205ENST00000426036 729 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 39.6
GRWD1Q9BQ67 LDHB-205ENST00000470280 710 ntTSL 216.13■□□□□ 0.175e-9■■■■■ 39.5
GRWD1Q9BQ67 LDHB-204ENST00000450584 732 ntTSL 314.49□□□□□ -0.095e-9■■■■■ 39.5
GRWD1Q9BQ67 LDHB-202ENST00000396075 744 ntTSL 312.98□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 39.5
GRWD1Q9BQ67 LIG1-216ENST00000598938 377 ntTSL 327.31■■□□□ 1.961e-10■■■■■ 39.4
GRWD1Q9BQ67 ACBD3-202ENST00000464927 294 ntTSL 26.51□□□□□ -1.372e-23■■■■■ 39.3
GRWD1Q9BQ67 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.752e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.912e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.522e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-206ENST00000481947 1260 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-205ENST00000466183 1130 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-205ENST00000614292 820 ntTSL 1 (best)30.16■■■□□ 2.427e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.737e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-209ENST00000639181 1534 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.37e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-204ENST00000613452 1050 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.027e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-210ENST00000640832 1709 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.367e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.17e-12■■■■■ 39
GRWD1Q9BQ67 NUP160-207ENST00000528501 1961 ntTSL 225.16■■□□□ 1.623e-8■■■■■ 38.9
GRWD1Q9BQ67 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 515.79■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 38.9
GRWD1Q9BQ67 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 219.94■□□□□ 0.784e-19■■■■■ 38.6
GRWD1Q9BQ67 SYAP1-202ENST00000495743 604 ntTSL 222■■□□□ 1.114e-10■■■■■ 38.5
GRWD1Q9BQ67 LIG1-208ENST00000595758 606 ntTSL 421.68■■□□□ 1.064e-12■■■■■ 38.4
GRWD1Q9BQ67 LIG1-209ENST00000596104 531 ntTSL 315.7■□□□□ 0.14e-12■■■■■ 38.4
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-201ENST00000368590 857 ntTSL 531.11■■■□□ 2.572e-10■■■■■ 38.3
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-206ENST00000518117 581 ntTSL 313.8□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 38.3
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-205ENST00000517800 446 ntTSL 312.26□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 38.3
GRWD1Q9BQ67 MARK3-219ENST00000559328 533 ntTSL 430.78■■■□□ 2.526e-23■■■■■ 38.1
GRWD1Q9BQ67 MARK3-221ENST00000560603 572 ntTSL 418.91■□□□□ 0.626e-23■■■■■ 38.1
GRWD1Q9BQ67 MARK3-225ENST00000561225 523 ntTSL 515.87■□□□□ 0.136e-23■■■■■ 38.1
GRWD1Q9BQ67 NSMCE4A-203ENST00000459911 541 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-13■■■■■ 37.8
GRWD1Q9BQ67 NSMCE4A-208ENST00000477289 643 ntTSL 215.03■□□□□ -03e-13■■■■■ 37.8
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-210ENST00000539250 701 ntTSL 215.46■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 37.7
GRWD1Q9BQ67 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.983e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 CYCS-204ENST00000413447 498 ntTSL 319.34■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 37.5
GRWD1Q9BQ67 ARHGEF10L-207ENST00000482359 604 ntTSL 522.77■■□□□ 1.245e-10■■■■■ 37.4
GRWD1Q9BQ67 EXOC4-222ENST00000492326 549 ntTSL 412.04□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 37.2
GRWD1Q9BQ67 PALMD-202ENST00000496843 5294 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.421e-11■■■■■ 37.2
GRWD1Q9BQ67 SORBS3-213ENST00000522037 718 ntTSL 322.72■■□□□ 1.236e-8■■■■■ 37.1
GRWD1Q9BQ67 SPCS3-204ENST00000513139 589 ntTSL 221.99■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 37
GRWD1Q9BQ67 GALNT12-202ENST00000470473 772 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 37
GRWD1Q9BQ67 POLG-224ENST00000637711 142 ntTSL 526.39■■□□□ 1.821e-11■■■■■ 36.7
GRWD1Q9BQ67 POLG-219ENST00000636937 100 ntTSL 57.73□□□□□ -1.171e-11■■■■■ 36.7
GRWD1Q9BQ67 CHAF1A-205ENST00000587580 494 ntTSL 335.93■■■■□ 3.341e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 CHAF1A-203ENST00000585854 499 ntTSL 231.88■■■□□ 2.691e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 FAM208B-202ENST00000380270 738 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 FAM208B-212ENST00000532080 485 ntTSL 212.27□□□□□ -0.451e-11■■■■■ 36.5
GRWD1Q9BQ67 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-10■■■■■ 36.4
GRWD1Q9BQ67 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 227.3■■□□□ 1.962e-11■■■■■ 36.1
GRWD1Q9BQ67 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 526.39■■□□□ 1.822e-11■■■■■ 36.1
GRWD1Q9BQ67 KIAA0895L-203ENST00000561679 2824 ntTSL 221.89■■□□□ 1.12e-11■■■■■ 36.1
GRWD1Q9BQ67 MIB2-212ENST00000486072 568 ntTSL 333.13■■■□□ 2.891e-8■■■■■ 36
GRWD1Q9BQ67 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 413.87□□□□□ -0.194e-19■■■■■ 36
GRWD1Q9BQ67 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 518.75■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 35.7
GRWD1Q9BQ67 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 518.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 35.7
GRWD1Q9BQ67 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 315.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 35.7
GRWD1Q9BQ67 FGFR1OP2-203ENST00000395941 865 ntTSL 229.92■■■□□ 2.383e-6■■■■■ 35.5
GRWD1Q9BQ67 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 35.5
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 DDX10-202ENST00000524979 794 ntTSL 315.51■□□□□ 0.073e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 DDX10-206ENST00000534221 870 ntTSL 214.88□□□□□ -0.033e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-11■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-9■■■■■ 35.3
GRWD1Q9BQ67 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 35.3
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