RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513139.1

SPCS3-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS3, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-204ENST00000513139 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.61■■■■□ 3.29
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SPCS3-204ENST00000513139 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.25■■■□□ 2.75
SPCS3-204ENST00000513139 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.9■■■□□ 2.54
SPCS3-204ENST00000513139 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.86■■■□□ 2.53
SPCS3-204ENST00000513139 NACADO15069 1562 aa30.55■■■□□ 2.48
SPCS3-204ENST00000513139 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.22■■■□□ 2.43
SPCS3-204ENST00000513139 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
SPCS3-204ENST00000513139 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SPCS3-204ENST00000513139 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.12■■■□□ 2.41
SPCS3-204ENST00000513139 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.02■■■□□ 2.4
SPCS3-204ENST00000513139 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.96■■■□□ 2.39
SPCS3-204ENST00000513139 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.87■■■□□ 2.37
SPCS3-204ENST00000513139 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.59■■■□□ 2.33
SPCS3-204ENST00000513139 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.45■■■□□ 2.31
SPCS3-204ENST00000513139 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.43■■■□□ 2.3
SPCS3-204ENST00000513139 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
SPCS3-204ENST00000513139 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
SPCS3-204ENST00000513139 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
SPCS3-204ENST00000513139 SCRIBQ14160 1630 aa29.22■■■□□ 2.27
SPCS3-204ENST00000513139 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.77■■■□□ 2.2
SPCS3-204ENST00000513139 CUX2O14529 1486 aa28.31■■■□□ 2.12
SPCS3-204ENST00000513139 NCAPD3P42695 1498 aa28.19■■■□□ 2.1
SPCS3-204ENST00000513139 ERCC6Q03468 1493 aa28.14■■■□□ 2.09
SPCS3-204ENST00000513139 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.01■■■□□ 2.07
SPCS3-204ENST00000513139 HMGXB3Q12766 1538 aa27.96■■■□□ 2.07
SPCS3-204ENST00000513139 SMARCA2P51531 1590 aa27.95■■■□□ 2.07
SPCS3-204ENST00000513139 SMARCA4P51532 1647 aa27.89■■■□□ 2.06
SPCS3-204ENST00000513139 NESP48681 1621 aa27.81■■■□□ 2.04
SPCS3-204ENST00000513139 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
SPCS3-204ENST00000513139 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SPCS3-204ENST00000513139 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
SPCS3-204ENST00000513139 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.67■■■□□ 2.02
SPCS3-204ENST00000513139 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.65■■■□□ 2.02
SPCS3-204ENST00000513139 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.52■■■□□ 2
SPCS3-204ENST00000513139 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.47■■□□□ 1.99
SPCS3-204ENST00000513139 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.39■■□□□ 1.98
SPCS3-204ENST00000513139 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.28■■□□□ 1.96
SPCS3-204ENST00000513139 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.25■■□□□ 1.95
SPCS3-204ENST00000513139 TRIM41Q8WV44 630 aa27.22■■□□□ 1.95
SPCS3-204ENST00000513139 WDR62O43379 1518 aa27.21■■□□□ 1.95
SPCS3-204ENST00000513139 WIZO95785 1651 aa27.08■■□□□ 1.92
SPCS3-204ENST00000513139 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.05■■□□□ 1.92
SPCS3-204ENST00000513139 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.96■■□□□ 1.91
SPCS3-204ENST00000513139 OSCARQ8IYS5 282 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS3-204ENST00000513139 CFTRP13569 1480 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS3-204ENST00000513139 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SPCS3-204ENST00000513139 PRDM2Q13029 1718 aa26.7■■□□□ 1.87
SPCS3-204ENST00000513139 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SPCS3-204ENST00000513139 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SPCS3-204ENST00000513139 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.62■■□□□ 1.85
SPCS3-204ENST00000513139 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.62■■□□□ 1.85
SPCS3-204ENST00000513139 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.62■■□□□ 1.85
SPCS3-204ENST00000513139 IFT140Q96RY7 1462 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SPCS3-204ENST00000513139 ARHGEF11O15085 1522 aa26.47■■□□□ 1.83
SPCS3-204ENST00000513139 TOPBP1Q92547 1522 aa26.41■■□□□ 1.82
SPCS3-204ENST00000513139 ABCC8Q09428 1581 aa26.38■■□□□ 1.81
SPCS3-204ENST00000513139 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.38■■□□□ 1.81
SPCS3-204ENST00000513139 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SPCS3-204ENST00000513139 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.3■■□□□ 1.8
SPCS3-204ENST00000513139 CHD1O14646 1710 aa26.29■■□□□ 1.8
SPCS3-204ENST00000513139 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SPCS3-204ENST00000513139 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.25■■□□□ 1.79
SPCS3-204ENST00000513139 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.783e-9■■■■■ 35.5
SPCS3-204ENST00000513139 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SPCS3-204ENST00000513139 ARAP1Q96P48 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
SPCS3-204ENST00000513139 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPCS3-204ENST00000513139 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SPCS3-204ENST00000513139 FBLN2P98095 1184 aa26.06■■□□□ 1.76
SPCS3-204ENST00000513139 WDR97A6NE52 1622 aa26.01■■□□□ 1.75
SPCS3-204ENST00000513139 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.97■■□□□ 1.75
SPCS3-204ENST00000513139 SOGA1O94964 1423 aa25.97■■□□□ 1.75
SPCS3-204ENST00000513139 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
SPCS3-204ENST00000513139 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SPCS3-204ENST00000513139 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.91■■□□□ 1.74
SPCS3-204ENST00000513139 SYNJ1O43426 1573 aa25.9■■□□□ 1.74
SPCS3-204ENST00000513139 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
SPCS3-204ENST00000513139 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.86■■□□□ 1.73
SPCS3-204ENST00000513139 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SPCS3-204ENST00000513139 GRIN2BQ13224 1484 aa25.82■■□□□ 1.72
SPCS3-204ENST00000513139 SYNJ2O15056 1496 aa25.79■■□□□ 1.72
SPCS3-204ENST00000513139 CUX1P39880 1505 aa25.78■■□□□ 1.72
SPCS3-204ENST00000513139 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SPCS3-204ENST00000513139 PBRM1Q86U86 1689 aa25.73■■□□□ 1.71
SPCS3-204ENST00000513139 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.67■■□□□ 1.7
SPCS3-204ENST00000513139 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.6■■□□□ 1.69
SPCS3-204ENST00000513139 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.58■■□□□ 1.69
SPCS3-204ENST00000513139 GRIN2AQ12879 1464 aa25.48■■□□□ 1.67
SPCS3-204ENST00000513139 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.46■■□□□ 1.67
SPCS3-204ENST00000513139 CEP170Q5SW79 1584 aa25.43■■□□□ 1.66
SPCS3-204ENST00000513139 NUP160Q12769 1436 aa25.42■■□□□ 1.66
SPCS3-204ENST00000513139 ADAMTS12P58397 1594 aa25.41■■□□□ 1.66
SPCS3-204ENST00000513139 SHROOM2Q13796 1616 aa25.41■■□□□ 1.66
SPCS3-204ENST00000513139 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
SPCS3-204ENST00000513139 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.34■■□□□ 1.65
SPCS3-204ENST00000513139 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.32■■□□□ 1.64
SPCS3-204ENST00000513139 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.31■■□□□ 1.64
SPCS3-204ENST00000513139 TOP2BQ02880 1626 aa25.29■■□□□ 1.64
SPCS3-204ENST00000513139 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
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