RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486072.1

MIB2-212, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-212ENST00000486072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.17■■■■■ 6.1
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MIB2-212ENST00000486072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.43■■■■■ 4.86
MIB2-212ENST00000486072 NACADO15069 1562 aa45.1■■■■■ 4.81
MIB2-212ENST00000486072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.88■■■■■ 4.78
MIB2-212ENST00000486072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.72■■■■■ 4.75
MIB2-212ENST00000486072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.44■■■■■ 4.71
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MIB2-212ENST00000486072 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.43■■■■■ 4.7
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MIB2-212ENST00000486072 SCRIBQ14160 1630 aa43.58■■■■■ 4.57
MIB2-212ENST00000486072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.48■■■■■ 4.55
MIB2-212ENST00000486072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.13■■■■■ 4.49
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MIB2-212ENST00000486072 CECR2Q9BXF3 1484 aa43■■■■■ 4.47
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MIB2-212ENST00000486072 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.53■■■■■ 4.24
MIB2-212ENST00000486072 SMARCA4P51532 1647 aa41.52■■■■■ 4.24
MIB2-212ENST00000486072 SMARCA2P51531 1590 aa41.42■■■■■ 4.22
MIB2-212ENST00000486072 HMGXB3Q12766 1538 aa41.35■■■■■ 4.21
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MIB2-212ENST00000486072 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.07■■■■■ 4.16
MIB2-212ENST00000486072 NESP48681 1621 aa41.04■■■■■ 4.16
MIB2-212ENST00000486072 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.02■■■■■ 4.16
MIB2-212ENST00000486072 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.01■■■■■ 4.16
MIB2-212ENST00000486072 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.7■■■■■ 4.11
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MIB2-212ENST00000486072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.53■■■■■ 4.08
MIB2-212ENST00000486072 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.45■■■■■ 4.07
MIB2-212ENST00000486072 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.35■■■■■ 4.05
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MIB2-212ENST00000486072 TRIM41Q8WV44 630 aa39.34■■■■□ 3.89
MIB2-212ENST00000486072 TOPBP1Q92547 1522 aa39.2■■■■□ 3.87
MIB2-212ENST00000486072 IFT140Q96RY7 1462 aa39.17■■■■□ 3.86
MIB2-212ENST00000486072 OSCARQ8IYS5 282 aa39.17■■■■□ 3.86
MIB2-212ENST00000486072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
MIB2-212ENST00000486072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.06■■■■□ 3.84
MIB2-212ENST00000486072 ABCC8Q09428 1581 aa39.04■■■■□ 3.84
MIB2-212ENST00000486072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
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MIB2-212ENST00000486072 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
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MIB2-212ENST00000486072 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
MIB2-212ENST00000486072 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
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MIB2-212ENST00000486072 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.66■■■■□ 3.78
MIB2-212ENST00000486072 ARHGEF11O15085 1522 aa38.65■■■■□ 3.78
MIB2-212ENST00000486072 SOGA1O94964 1423 aa38.58■■■■□ 3.77
MIB2-212ENST00000486072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.58■■■■□ 3.77
MIB2-212ENST00000486072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
MIB2-212ENST00000486072 CUX1P39880 1505 aa38.53■■■■□ 3.76
MIB2-212ENST00000486072 FBLN2P98095 1184 aa38.52■■■■□ 3.76
MIB2-212ENST00000486072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.42■■■■□ 3.74
MIB2-212ENST00000486072 WDR97A6NE52 1622 aa38.41■■■■□ 3.74
MIB2-212ENST00000486072 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
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MIB2-212ENST00000486072 ARAP1Q96P48 1450 aa38.28■■■■□ 3.72
MIB2-212ENST00000486072 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
MIB2-212ENST00000486072 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
MIB2-212ENST00000486072 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.2■■■■□ 3.71
MIB2-212ENST00000486072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
MIB2-212ENST00000486072 PBRM1Q86U86 1689 aa38.17■■■■□ 3.7
MIB2-212ENST00000486072 SYNJ1O43426 1573 aa38.17■■■■□ 3.7
MIB2-212ENST00000486072 SYNJ2O15056 1496 aa38.15■■■■□ 3.7
MIB2-212ENST00000486072 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.13■■■■□ 3.69
MIB2-212ENST00000486072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.1■■■■□ 3.69
MIB2-212ENST00000486072 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.09■■■■□ 3.69
MIB2-212ENST00000486072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.94■■■■□ 3.66
MIB2-212ENST00000486072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.91■■■■□ 3.66
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MIB2-212ENST00000486072 TOP2BQ02880 1626 aa37.9■■■■□ 3.66
MIB2-212ENST00000486072 ADAMTS12P58397 1594 aa37.82■■■■□ 3.65
MIB2-212ENST00000486072 GRIN2AQ12879 1464 aa37.8■■■■□ 3.64
MIB2-212ENST00000486072 CEP170Q5SW79 1584 aa37.69■■■■□ 3.62
MIB2-212ENST00000486072 NUP160Q12769 1436 aa37.65■■■■□ 3.62
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MIB2-212ENST00000486072 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.63■■■■□ 3.62
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MIB2-212ENST00000486072 SHROOM2Q13796 1616 aa37.49■■■■□ 3.59
MIB2-212ENST00000486072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.3■■■■□ 3.56
MIB2-212ENST00000486072 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
MIB2-212ENST00000486072 JPH4Q96JJ6 628 aa37.2■■■■□ 3.55
MIB2-212ENST00000486072 KIF27Q86VH2 1401 aa37.15■■■■□ 3.54
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