RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486072.1

MIB2-212, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-212ENST00000486072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.17■■■■■ 6.1
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MIB2-212ENST00000486072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.43■■■■■ 4.86
MIB2-212ENST00000486072 NACADO15069 1562 aa45.1■■■■■ 4.81
MIB2-212ENST00000486072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.88■■■■■ 4.78
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MIB2-212ENST00000486072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.44■■■■■ 4.71
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MIB2-212ENST00000486072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.48■■■■■ 4.55
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MIB2-212ENST00000486072 CECR2Q9BXF3 1484 aa43■■■■■ 4.47
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MIB2-212ENST00000486072 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.07■■■■■ 4.16
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MIB2-212ENST00000486072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.53■■■■■ 4.08
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MIB2-212ENST00000486072 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.35■■■■■ 4.05
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MIB2-212ENST00000486072 TOPBP1Q92547 1522 aa39.2■■■■□ 3.87
MIB2-212ENST00000486072 IFT140Q96RY7 1462 aa39.17■■■■□ 3.86
MIB2-212ENST00000486072 OSCARQ8IYS5 282 aa39.17■■■■□ 3.86
MIB2-212ENST00000486072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
MIB2-212ENST00000486072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.06■■■■□ 3.84
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MIB2-212ENST00000486072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.58■■■■□ 3.77
MIB2-212ENST00000486072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
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MIB2-212ENST00000486072 FBLN2P98095 1184 aa38.52■■■■□ 3.76
MIB2-212ENST00000486072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.42■■■■□ 3.74
MIB2-212ENST00000486072 WDR97A6NE52 1622 aa38.41■■■■□ 3.74
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MIB2-212ENST00000486072 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
MIB2-212ENST00000486072 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
MIB2-212ENST00000486072 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.2■■■■□ 3.71
MIB2-212ENST00000486072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
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MIB2-212ENST00000486072 SYNJ1O43426 1573 aa38.17■■■■□ 3.7
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MIB2-212ENST00000486072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.1■■■■□ 3.69
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MIB2-212ENST00000486072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.94■■■■□ 3.66
MIB2-212ENST00000486072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.91■■■■□ 3.66
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MIB2-212ENST00000486072 TOP2BQ02880 1626 aa37.9■■■■□ 3.66
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MIB2-212ENST00000486072 CEP170Q5SW79 1584 aa37.69■■■■□ 3.62
MIB2-212ENST00000486072 NUP160Q12769 1436 aa37.65■■■■□ 3.62
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MIB2-212ENST00000486072 SHROOM2Q13796 1616 aa37.49■■■■□ 3.59
MIB2-212ENST00000486072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.3■■■■□ 3.56
MIB2-212ENST00000486072 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
MIB2-212ENST00000486072 JPH4Q96JJ6 628 aa37.2■■■■□ 3.55
MIB2-212ENST00000486072 KIF27Q86VH2 1401 aa37.15■■■■□ 3.54
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