RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587580.1

CHAF1A-205, Transcript of chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene CHAF1A, Length 494 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1A-205ENST00000587580 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.47■■■■■ 6.79
CHAF1A-205ENST00000587580 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.23■■■■■ 5.79
CHAF1A-205ENST00000587580 ABCC9O60706 1549 aa50.31■■■■■ 5.64
CHAF1A-205ENST00000587580 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.3■■■■■ 5.32
CHAF1A-205ENST00000587580 NACADO15069 1562 aa48.17■■■■■ 5.3
CHAF1A-205ENST00000587580 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.08■■■■■ 5.29
CHAF1A-205ENST00000587580 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
CHAF1A-205ENST00000587580 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.79■■■■■ 5.24
CHAF1A-205ENST00000587580 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.52■■■■■ 5.2
CHAF1A-205ENST00000587580 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.25■■■■■ 5.15
CHAF1A-205ENST00000587580 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.1
CHAF1A-205ENST00000587580 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.84■■■■■ 5.09
CHAF1A-205ENST00000587580 SCRIBQ14160 1630 aa46.75■■■■■ 5.07
CHAF1A-205ENST00000587580 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.31■■■■■ 5
CHAF1A-205ENST00000587580 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.29■■■■■ 5
CHAF1A-205ENST00000587580 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
CHAF1A-205ENST00000587580 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.5■■■■■ 4.87
CHAF1A-205ENST00000587580 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.21■■■■■ 4.83
CHAF1A-205ENST00000587580 SMARCA4P51532 1647 aa44.68■■■■■ 4.74
CHAF1A-205ENST00000587580 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.73
CHAF1A-205ENST00000587580 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.44■■■■■ 4.7
CHAF1A-205ENST00000587580 NCAPD3P42695 1498 aa44.42■■■■■ 4.7
CHAF1A-205ENST00000587580 SMARCA2P51531 1590 aa44.39■■■■■ 4.7
CHAF1A-205ENST00000587580 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.3■■■■■ 4.68
CHAF1A-205ENST00000587580 HMGXB3Q12766 1538 aa44.24■■■■■ 4.67
CHAF1A-205ENST00000587580 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.21■■■■■ 4.67
CHAF1A-205ENST00000587580 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
CHAF1A-205ENST00000587580 WIZO95785 1651 aa43.84■■■■■ 4.61
CHAF1A-205ENST00000587580 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
CHAF1A-205ENST00000587580 NESP48681 1621 aa43.47■■■■■ 4.55
CHAF1A-205ENST00000587580 ERCC6Q03468 1493 aa43.38■■■■■ 4.54
CHAF1A-205ENST00000587580 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
CHAF1A-205ENST00000587580 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.33■■■■■ 4.53
CHAF1A-205ENST00000587580 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.12■■■■■ 4.49
CHAF1A-205ENST00000587580 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.02■■■■■ 4.48
CHAF1A-205ENST00000587580 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.99■■■■■ 4.47
CHAF1A-205ENST00000587580 CUX2O14529 1486 aa42.98■■■■■ 4.47
CHAF1A-205ENST00000587580 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
CHAF1A-205ENST00000587580 CFTRP13569 1480 aa42.84■■■■■ 4.45
CHAF1A-205ENST00000587580 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.81■■■■■ 4.44
CHAF1A-205ENST00000587580 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.67■■■■■ 4.42
CHAF1A-205ENST00000587580 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.65■■■■■ 4.42
CHAF1A-205ENST00000587580 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.62■■■■■ 4.41
CHAF1A-205ENST00000587580 PRDM2Q13029 1718 aa42.58■■■■■ 4.41
CHAF1A-205ENST00000587580 WDR62O43379 1518 aa42.5■■■■■ 4.39
CHAF1A-205ENST00000587580 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CHAF1A-205ENST00000587580 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CHAF1A-205ENST00000587580 TOPBP1Q92547 1522 aa41.96■■■■■ 4.31
CHAF1A-205ENST00000587580 ABCC8Q09428 1581 aa41.92■■■■■ 4.3
CHAF1A-205ENST00000587580 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.92■■■■■ 4.3
CHAF1A-205ENST00000587580 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.83■■■■■ 4.29
CHAF1A-205ENST00000587580 IFT140Q96RY7 1462 aa41.74■■■■■ 4.27
CHAF1A-205ENST00000587580 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
CHAF1A-205ENST00000587580 CUX1P39880 1505 aa41.58■■■■■ 4.25
CHAF1A-205ENST00000587580 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CHAF1A-205ENST00000587580 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
CHAF1A-205ENST00000587580 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.48■■■■■ 4.23
CHAF1A-205ENST00000587580 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
CHAF1A-205ENST00000587580 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.42■■■■■ 4.22
CHAF1A-205ENST00000587580 SOGA1O94964 1423 aa41.39■■■■■ 4.22
CHAF1A-205ENST00000587580 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.3■■■■■ 4.29e-7■■■■■ 48.6
CHAF1A-205ENST00000587580 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
CHAF1A-205ENST00000587580 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
CHAF1A-205ENST00000587580 WDR97A6NE52 1622 aa41.18■■■■■ 4.18
CHAF1A-205ENST00000587580 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.18■■■■■ 4.18
CHAF1A-205ENST00000587580 TOP2BQ02880 1626 aa41.17■■■■■ 4.18
CHAF1A-205ENST00000587580 SYNJ1O43426 1573 aa41.16■■■■■ 4.18
CHAF1A-205ENST00000587580 OSCARQ8IYS5 282 aa41.11■■■■■ 4.17
CHAF1A-205ENST00000587580 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.04■■■■■ 4.16
CHAF1A-205ENST00000587580 CHD1O14646 1710 aa40.98■■■■■ 4.15
CHAF1A-205ENST00000587580 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
CHAF1A-205ENST00000587580 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.96■■■■■ 4.15
CHAF1A-205ENST00000587580 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.93■■■■■ 4.14
CHAF1A-205ENST00000587580 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.93■■■■■ 4.14
CHAF1A-205ENST00000587580 PBRM1Q86U86 1689 aa40.92■■■■■ 4.14
CHAF1A-205ENST00000587580 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHAF1A-205ENST00000587580 FBLN2P98095 1184 aa40.85■■■■■ 4.13
CHAF1A-205ENST00000587580 SYNJ2O15056 1496 aa40.71■■■■■ 4.11
CHAF1A-205ENST00000587580 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
CHAF1A-205ENST00000587580 ADAMTS12P58397 1594 aa40.57■■■■■ 4.09
CHAF1A-205ENST00000587580 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.56■■■■■ 4.08
CHAF1A-205ENST00000587580 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.56■■■■■ 4.08
CHAF1A-205ENST00000587580 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.56■■■■■ 4.08
CHAF1A-205ENST00000587580 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.56■■■■■ 4.08
CHAF1A-205ENST00000587580 ARHGEF11O15085 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
CHAF1A-205ENST00000587580 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.49■■■■■ 4.07
CHAF1A-205ENST00000587580 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.44■■■■■ 4.06
CHAF1A-205ENST00000587580 TRIM41Q8WV44 630 aa40.44■■■■■ 4.06
CHAF1A-205ENST00000587580 GRIN2AQ12879 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
CHAF1A-205ENST00000587580 KIF27Q86VH2 1401 aa40.37■■■■■ 4.05
CHAF1A-205ENST00000587580 CEP170Q5SW79 1584 aa40.27■■■■■ 4.04
CHAF1A-205ENST00000587580 NUP160Q12769 1436 aa40.25■■■■■ 4.03
CHAF1A-205ENST00000587580 IGF1RP08069 1367 aa40.2■■■■■ 4.03
CHAF1A-205ENST00000587580 CUL7Q14999 1698 aa40.18■■■■■ 4.02
CHAF1A-205ENST00000587580 ARAP1Q96P48 1450 aa40.18■■■■■ 4.02
CHAF1A-205ENST00000587580 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.1■■■■■ 4.01
CHAF1A-205ENST00000587580 SHROOM2Q13796 1616 aa39.99■■■■□ 3.99
CHAF1A-205ENST00000587580 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.98■■■■□ 3.99
CHAF1A-205ENST00000587580 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.97■■■■□ 3.99
CHAF1A-205ENST00000587580 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.93■■■■□ 3.98
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