Protein–RNA interactions for Protein: Q99603

TRGV9, T-cell receptor gamma variable 9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV9Q99603 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRGV9Q99603 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRGV9Q99603 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRGV9Q99603 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRGV9Q99603 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRGV9Q99603 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRGV9Q99603 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRGV9Q99603 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRGV9Q99603 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRGV9Q99603 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRGV9Q99603 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRGV9Q99603 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRGV9Q99603 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRGV9Q99603 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRGV9Q99603 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRGV9Q99603 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRGV9Q99603 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRGV9Q99603 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRGV9Q99603 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRGV9Q99603 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRGV9Q99603 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRGV9Q99603 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRGV9Q99603 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRGV9Q99603 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRGV9Q99603 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRGV9Q99603 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRGV9Q99603 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRGV9Q99603 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRGV9Q99603 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRGV9Q99603 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRGV9Q99603 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRGV9Q99603 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRGV9Q99603 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRGV9Q99603 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRGV9Q99603 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRGV9Q99603 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRGV9Q99603 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRGV9Q99603 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRGV9Q99603 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRGV9Q99603 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRGV9Q99603 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRGV9Q99603 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRGV9Q99603 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRGV9Q99603 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRGV9Q99603 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRGV9Q99603 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRGV9Q99603 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRGV9Q99603 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRGV9Q99603 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRGV9Q99603 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRGV9Q99603 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRGV9Q99603 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRGV9Q99603 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRGV9Q99603 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRGV9Q99603 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRGV9Q99603 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRGV9Q99603 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRGV9Q99603 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRGV9Q99603 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRGV9Q99603 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRGV9Q99603 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRGV9Q99603 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRGV9Q99603 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRGV9Q99603 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRGV9Q99603 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRGV9Q99603 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRGV9Q99603 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRGV9Q99603 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRGV9Q99603 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRGV9Q99603 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRGV9Q99603 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRGV9Q99603 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRGV9Q99603 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRGV9Q99603 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV9Q99603 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRGV9Q99603 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV9Q99603 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV9Q99603 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV9Q99603 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRGV9Q99603 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRGV9Q99603 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRGV9Q99603 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRGV9Q99603 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRGV9Q99603 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRGV9Q99603 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRGV9Q99603 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRGV9Q99603 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRGV9Q99603 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms