Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SPOCD1Q6ZMY3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SPOCD1Q6ZMY3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SPOCD1Q6ZMY3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPOCD1Q6ZMY3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPOCD1Q6ZMY3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPOCD1Q6ZMY3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SPOCD1Q6ZMY3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPOCD1Q6ZMY3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPOCD1Q6ZMY3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPOCD1Q6ZMY3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPOCD1Q6ZMY3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPOCD1Q6ZMY3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPOCD1Q6ZMY3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPOCD1Q6ZMY3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPOCD1Q6ZMY3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPOCD1Q6ZMY3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPOCD1Q6ZMY3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPOCD1Q6ZMY3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPOCD1Q6ZMY3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPOCD1Q6ZMY3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPOCD1Q6ZMY3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPOCD1Q6ZMY3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPOCD1Q6ZMY3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPOCD1Q6ZMY3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPOCD1Q6ZMY3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPOCD1Q6ZMY3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPOCD1Q6ZMY3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SPOCD1Q6ZMY3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SPOCD1Q6ZMY3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SPOCD1Q6ZMY3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPOCD1Q6ZMY3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SPOCD1Q6ZMY3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SPOCD1Q6ZMY3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SPOCD1Q6ZMY3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPOCD1Q6ZMY3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SPOCD1Q6ZMY3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SPOCD1Q6ZMY3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SPOCD1Q6ZMY3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SPOCD1Q6ZMY3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPOCD1Q6ZMY3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SPOCD1Q6ZMY3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SPOCD1Q6ZMY3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPOCD1Q6ZMY3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPOCD1Q6ZMY3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPOCD1Q6ZMY3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SPOCD1Q6ZMY3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SPOCD1Q6ZMY3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPOCD1Q6ZMY3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPOCD1Q6ZMY3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPOCD1Q6ZMY3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPOCD1Q6ZMY3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SPOCD1Q6ZMY3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPOCD1Q6ZMY3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPOCD1Q6ZMY3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPOCD1Q6ZMY3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPOCD1Q6ZMY3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPOCD1Q6ZMY3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPOCD1Q6ZMY3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPOCD1Q6ZMY3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPOCD1Q6ZMY3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPOCD1Q6ZMY3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPOCD1Q6ZMY3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms