Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC153Q494R4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC153Q494R4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC153Q494R4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC153Q494R4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC153Q494R4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC153Q494R4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC153Q494R4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC153Q494R4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC153Q494R4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC153Q494R4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC153Q494R4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC153Q494R4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC153Q494R4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC153Q494R4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC153Q494R4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC153Q494R4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC153Q494R4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC153Q494R4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC153Q494R4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC153Q494R4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC153Q494R4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC153Q494R4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC153Q494R4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC153Q494R4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC153Q494R4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC153Q494R4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC153Q494R4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC153Q494R4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC153Q494R4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC153Q494R4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC153Q494R4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC153Q494R4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC153Q494R4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC153Q494R4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC153Q494R4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC153Q494R4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC153Q494R4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC153Q494R4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC153Q494R4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC153Q494R4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC153Q494R4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC153Q494R4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC153Q494R4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC153Q494R4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC153Q494R4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC153Q494R4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC153Q494R4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC153Q494R4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC153Q494R4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC153Q494R4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC153Q494R4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC153Q494R4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC153Q494R4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC153Q494R4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC153Q494R4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC153Q494R4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC153Q494R4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC153Q494R4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC153Q494R4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC153Q494R4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC153Q494R4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC153Q494R4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC153Q494R4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC153Q494R4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC153Q494R4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC153Q494R4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC153Q494R4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC153Q494R4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC153Q494R4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC153Q494R4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC153Q494R4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC153Q494R4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC153Q494R4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC153Q494R4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC153Q494R4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC153Q494R4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC153Q494R4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC153Q494R4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC153Q494R4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC153Q494R4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC153Q494R4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC153Q494R4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC153Q494R4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC153Q494R4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC153Q494R4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC153Q494R4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC153Q494R4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC153Q494R4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC153Q494R4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC153Q494R4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC153Q494R4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC153Q494R4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms