Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.32■■□□□ 1.165e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.925e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 219.79■□□□□ 0.765e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 218.99■□□□□ 0.635e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.495e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.615e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39□□□□□ -0.975e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.94□□□□□ -0.985e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.65□□□□□ -1.025e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.48□□□□□ -1.535e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.43□□□□□ -1.75e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 54.21□□□□□ -1.745e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.155e-35■■■■■ 127.1
HLTFQ14527 TSC22D1-208ENST00000493016 690 ntTSL 416.3■□□□□ 0.23e-14■■■■■ 52.5
HLTFQ14527 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.086e-12■■■■■ 43.8
HLTFQ14527 CCDC138-202ENST00000409529 2364 ntTSL 214.21□□□□□ -0.136e-12■■■■■ 43.8
HLTFQ14527 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.26e-12■■■■■ 43.8
HLTFQ14527 CCDC138-205ENST00000456512 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.6□□□□□ -1.676e-12■■■■■ 43.8
HLTFQ14527 GATS-208ENST00000445230 451 ntTSL 37.78□□□□□ -1.161e-10■■■■■ 39.1
HLTFQ14527 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 37.9
HLTFQ14527 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 37.9
HLTFQ14527 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 37.9
HLTFQ14527 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-9■■■■■ 35.5
HLTFQ14527 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 517.02■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 35.5
HLTFQ14527 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 516.77■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 35.5
HLTFQ14527 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 35.5
HLTFQ14527 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 514.07□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 35.5
HLTFQ14527 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-9■■■■■ 35.5
HLTFQ14527 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.61e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-207ENST00000430601 682 ntTSL 320.69■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 517.36■□□□□ 0.371e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.31e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 315.75■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 35.4
HLTFQ14527 ZFP62-203ENST00000506377 725 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 35
HLTFQ14527 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 35
HLTFQ14527 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 35
HLTFQ14527 LINC01344-203ENST00000608183 2631 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 34.2
HLTFQ14527 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.13□□□□□ -1.591e-8■■■■■ 33.8
HLTFQ14527 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.77e-9■■■■■ 33
HLTFQ14527 MTHFD1L-207ENST00000441122 1134 ntTSL 517.99■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 33
HLTFQ14527 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.437e-9■■■■■ 33
HLTFQ14527 MTHFD1L-202ENST00000367308 996 ntTSL 517.29■□□□□ 0.367e-9■■■■■ 33
HLTFQ14527 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.867e-9■■■■■ 33
HLTFQ14527 VPS13B-208ENST00000521037 486 ntTSL 54.35□□□□□ -1.717e-9■■■■■ 33
HLTFQ14527 FAM208B-202ENST00000380270 738 ntTSL 35.16□□□□□ -1.587e-8■■■■■ 33
HLTFQ14527 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 32.4
HLTFQ14527 CCDC14-216ENST00000483247 697 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 32.4
HLTFQ14527 CCDC14-212ENST00000471054 544 ntTSL 45.86□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 32.4
HLTFQ14527 CCDC14-218ENST00000485949 439 ntTSL 25.77□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 32.4
HLTFQ14527 CCDC14-205ENST00000419247 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.77□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 32.4
HLTFQ14527 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 32.3
HLTFQ14527 CTDSPL-202ENST00000310189 1482 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 32
HLTFQ14527 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 31.9
HLTFQ14527 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 31.9
HLTFQ14527 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 424.3■■□□□ 1.481e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 422.68■■□□□ 1.221e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 421.54■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-215ENST00000560089 2804 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-211ENST00000559322 559 ntTSL 419.46■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-210ENST00000559300 541 ntTSL 417.9■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-203ENST00000558051 552 ntTSL 416.61■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 THOC1-214ENST00000582313 1811 ntTSL 510.02□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 ARID5B-202ENST00000309334 3141 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.451e-8■■■■■ 31.8
HLTFQ14527 DST-224ENST00000521821 735 ntTSL 28.06□□□□□ -1.127e-8■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 DST-235ENST00000633795 912 ntTSL 1 (best)5.35□□□□□ -1.557e-8■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 31.2
HLTFQ14527 KIAA0232-205ENST00000508423 700 ntTSL 221.31■■□□□ 12e-8■■■■■ 30.8
HLTFQ14527 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 30.8
HLTFQ14527 PCNX1-207ENST00000554691 4204 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 30.8
HLTFQ14527 KIAA0232-204ENST00000503278 563 ntTSL 46.34□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 30.8
HLTFQ14527 NSUN6-207ENST00000606425 578 ntTSL 44.97□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 30.8
HLTFQ14527 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.693e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-202ENST00000341028 881 ntTSL 222.44■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-206ENST00000615951 2227 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-205ENST00000611150 2350 ntTSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 GYG2-206ENST00000453106 1158 ntTSL 213.13□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 212.82□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 GYG2-202ENST00000381157 731 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 6,978 protein–RNA pairs in 38.4 ms