RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.24■■■■■ 5.47
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC9O60706 1549 aa45.38■■■■■ 4.86
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.51■■■■■ 4.72
SEMA4B-211ENST00000559322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.22■■■■■ 4.51
SEMA4B-211ENST00000559322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.82■■■■■ 4.45
SEMA4B-211ENST00000559322 NACADO15069 1562 aa42.31■■■■■ 4.36
SEMA4B-211ENST00000559322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.15■■■■■ 4.34
SEMA4B-211ENST00000559322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.08■■■■■ 4.33
SEMA4B-211ENST00000559322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.75■■■■■ 4.27
SEMA4B-211ENST00000559322 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.53■■■■■ 4.24
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.42■■■■■ 4.22
SEMA4B-211ENST00000559322 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
SEMA4B-211ENST00000559322 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.93■■■■■ 4.14
SEMA4B-211ENST00000559322 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.92■■■■■ 4.14
SEMA4B-211ENST00000559322 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
SEMA4B-211ENST00000559322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
SEMA4B-211ENST00000559322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.59■■■■■ 4.09
SEMA4B-211ENST00000559322 SCRIBQ14160 1630 aa40.57■■■■■ 4.09
SEMA4B-211ENST00000559322 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.32■■■■■ 4.05
SEMA4B-211ENST00000559322 CUX2O14529 1486 aa39.43■■■■□ 3.9
SEMA4B-211ENST00000559322 ERCC6Q03468 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
SEMA4B-211ENST00000559322 NCAPD3P42695 1498 aa39.06■■■■□ 3.84
SEMA4B-211ENST00000559322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.84■■■■□ 3.81
SEMA4B-211ENST00000559322 NESP48681 1621 aa38.72■■■■□ 3.79
SEMA4B-211ENST00000559322 SMARCA2P51531 1590 aa38.7■■■■□ 3.79
SEMA4B-211ENST00000559322 HMGXB3Q12766 1538 aa38.69■■■■□ 3.78
SEMA4B-211ENST00000559322 SMARCA4P51532 1647 aa38.59■■■■□ 3.77
SEMA4B-211ENST00000559322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
SEMA4B-211ENST00000559322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
SEMA4B-211ENST00000559322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.32■■■■□ 3.73
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM41Q8WV44 630 aa38.32■■■■□ 3.72
SEMA4B-211ENST00000559322 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
SEMA4B-211ENST00000559322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.18■■■■□ 3.7
SEMA4B-211ENST00000559322 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.18■■■■□ 3.7
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.17■■■■□ 3.7
SEMA4B-211ENST00000559322 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.93■■■■□ 3.66
SEMA4B-211ENST00000559322 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.87■■■■□ 3.65
SEMA4B-211ENST00000559322 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.87■■■■□ 3.65
SEMA4B-211ENST00000559322 WDR62O43379 1518 aa37.77■■■■□ 3.64
SEMA4B-211ENST00000559322 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.58■■■■□ 3.61
SEMA4B-211ENST00000559322 OSCARQ8IYS5 282 aa37.54■■■■□ 3.6
SEMA4B-211ENST00000559322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.45■■■■□ 3.59
SEMA4B-211ENST00000559322 WIZO95785 1651 aa37.44■■■■□ 3.58
SEMA4B-211ENST00000559322 CFTRP13569 1480 aa37.24■■■■□ 3.55
SEMA4B-211ENST00000559322 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
SEMA4B-211ENST00000559322 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.08■■■■□ 3.53
SEMA4B-211ENST00000559322 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.08■■■■□ 3.53
SEMA4B-211ENST00000559322 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.08■■■■□ 3.53
SEMA4B-211ENST00000559322 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF11O15085 1522 aa36.89■■■■□ 3.5
SEMA4B-211ENST00000559322 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
SEMA4B-211ENST00000559322 IFT140Q96RY7 1462 aa36.85■■■■□ 3.49
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
SEMA4B-211ENST00000559322 PRDM2Q13029 1718 aa36.75■■■■□ 3.47
SEMA4B-211ENST00000559322 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.74■■■■□ 3.47
SEMA4B-211ENST00000559322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA4B-211ENST00000559322 TOPBP1Q92547 1522 aa36.63■■■■□ 3.45
SEMA4B-211ENST00000559322 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.52■■■■□ 3.44
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC8Q09428 1581 aa36.52■■■■□ 3.44
SEMA4B-211ENST00000559322 CHD1O14646 1710 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA4B-211ENST00000559322 ARAP1Q96P48 1450 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA4B-211ENST00000559322 FBLN2P98095 1184 aa36.45■■■■□ 3.43
SEMA4B-211ENST00000559322 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.427e-7■■■■□ 20.1
SEMA4B-211ENST00000559322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.42■■■■□ 3.42
SEMA4B-211ENST00000559322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
SEMA4B-211ENST00000559322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
SEMA4B-211ENST00000559322 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
SEMA4B-211ENST00000559322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.11■■■■□ 3.37
SEMA4B-211ENST00000559322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
SEMA4B-211ENST00000559322 SOGA1O94964 1423 aa36.06■■■■□ 3.36
SEMA4B-211ENST00000559322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.05■■■■□ 3.36
SEMA4B-211ENST00000559322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
SEMA4B-211ENST00000559322 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.02■■■■□ 3.36
SEMA4B-211ENST00000559322 SYNJ1O43426 1573 aa35.98■■■■□ 3.35
SEMA4B-211ENST00000559322 WDR97A6NE52 1622 aa35.92■■■■□ 3.34
SEMA4B-211ENST00000559322 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
SEMA4B-211ENST00000559322 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.87■■■■□ 3.33
SEMA4B-211ENST00000559322 GRIN2BQ13224 1484 aa35.83■■■■□ 3.33
SEMA4B-211ENST00000559322 SYNJ2O15056 1496 aa35.8■■■■□ 3.32
SEMA4B-211ENST00000559322 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.74■■■■□ 3.31
SEMA4B-211ENST00000559322 CUX1P39880 1505 aa35.69■■■■□ 3.3
SEMA4B-211ENST00000559322 PBRM1Q86U86 1689 aa35.59■■■■□ 3.29
SEMA4B-211ENST00000559322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.41■■■■□ 3.26
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.4■■■■□ 3.26
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.4■■■■□ 3.26
SEMA4B-211ENST00000559322 GRIN2AQ12879 1464 aa35.35■■■■□ 3.25
SEMA4B-211ENST00000559322 CEP170Q5SW79 1584 aa35.3■■■■□ 3.24
SEMA4B-211ENST00000559322 NUP160Q12769 1436 aa35.24■■■■□ 3.23
SEMA4B-211ENST00000559322 ADAMTS12P58397 1594 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA4B-211ENST00000559322 SHROOM2Q13796 1616 aa35.15■■■■□ 3.22
SEMA4B-211ENST00000559322 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
SEMA4B-211ENST00000559322 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.12■■■■□ 3.21
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.11■■■■□ 3.21
SEMA4B-211ENST00000559322 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.98■■■■□ 3.19
SEMA4B-211ENST00000559322 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.95■■■■□ 3.19
SEMA4B-211ENST00000559322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.94■■■■□ 3.18
SEMA4B-211ENST00000559322 JPH4Q96JJ6 628 aa34.93■■■■□ 3.18
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.9■■■■□ 3.18
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