RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561085.1

SEMA4B-218, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-218ENST00000561085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
SEMA4B-218ENST00000561085 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.38■■■■■ 5.49
SEMA4B-218ENST00000561085 ABCC9O60706 1549 aa48.16■■■■■ 5.3
SEMA4B-218ENST00000561085 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.45■■■■■ 5.03
SEMA4B-218ENST00000561085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.4■■■■■ 5.02
SEMA4B-218ENST00000561085 NACADO15069 1562 aa46.39■■■■■ 5.02
SEMA4B-218ENST00000561085 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
SEMA4B-218ENST00000561085 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.16■■■■■ 4.98
SEMA4B-218ENST00000561085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.03■■■■■ 4.96
SEMA4B-218ENST00000561085 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.38■■■■■ 4.86
SEMA4B-218ENST00000561085 SCRIBQ14160 1630 aa45.05■■■■■ 4.8
SEMA4B-218ENST00000561085 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.05■■■■■ 4.8
SEMA4B-218ENST00000561085 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.99■■■■■ 4.79
SEMA4B-218ENST00000561085 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.51■■■■■ 4.72
SEMA4B-218ENST00000561085 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.08■■■■■ 4.65
SEMA4B-218ENST00000561085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
SEMA4B-218ENST00000561085 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.58■■■■■ 4.57
SEMA4B-218ENST00000561085 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.32■■■■■ 4.52
SEMA4B-218ENST00000561085 SMARCA4P51532 1647 aa43.12■■■■■ 4.49
SEMA4B-218ENST00000561085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
SEMA4B-218ENST00000561085 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.87■■■■■ 4.45
SEMA4B-218ENST00000561085 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.85■■■■■ 4.45
SEMA4B-218ENST00000561085 SMARCA2P51531 1590 aa42.81■■■■■ 4.44
SEMA4B-218ENST00000561085 NCAPD3P42695 1498 aa42.81■■■■■ 4.44
SEMA4B-218ENST00000561085 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.69■■■■■ 4.43
SEMA4B-218ENST00000561085 HMGXB3Q12766 1538 aa42.6■■■■■ 4.41
SEMA4B-218ENST00000561085 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
SEMA4B-218ENST00000561085 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
SEMA4B-218ENST00000561085 WIZO95785 1651 aa42.43■■■■■ 4.38
SEMA4B-218ENST00000561085 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SEMA4B-218ENST00000561085 NESP48681 1621 aa41.72■■■■■ 4.27
SEMA4B-218ENST00000561085 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.65■■■■■ 4.26
SEMA4B-218ENST00000561085 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.58■■■■■ 4.25
SEMA4B-218ENST00000561085 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
SEMA4B-218ENST00000561085 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.49■■■■■ 4.23
SEMA4B-218ENST00000561085 ERCC6Q03468 1493 aa41.49■■■■■ 4.23
SEMA4B-218ENST00000561085 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.36■■■■■ 4.21
SEMA4B-218ENST00000561085 CFTRP13569 1480 aa41.35■■■■■ 4.21
SEMA4B-218ENST00000561085 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.24■■■■■ 4.19
SEMA4B-218ENST00000561085 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.09■■■■■ 4.17
SEMA4B-218ENST00000561085 PRDM2Q13029 1718 aa41.07■■■■■ 4.17
SEMA4B-218ENST00000561085 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
SEMA4B-218ENST00000561085 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.01■■■■■ 4.16
SEMA4B-218ENST00000561085 CUX2O14529 1486 aa40.99■■■■■ 4.15
SEMA4B-218ENST00000561085 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.92■■■■■ 4.14
SEMA4B-218ENST00000561085 WDR62O43379 1518 aa40.77■■■■■ 4.12
SEMA4B-218ENST00000561085 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SEMA4B-218ENST00000561085 ABCC8Q09428 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
SEMA4B-218ENST00000561085 TOPBP1Q92547 1522 aa40.45■■■■■ 4.07
SEMA4B-218ENST00000561085 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.41■■■■■ 4.06
SEMA4B-218ENST00000561085 CUX1P39880 1505 aa40.2■■■■■ 4.03
SEMA4B-218ENST00000561085 IFT140Q96RY7 1462 aa40.15■■■■■ 4.02
SEMA4B-218ENST00000561085 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
SEMA4B-218ENST00000561085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.04■■■■■ 4
SEMA4B-218ENST00000561085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.01■■■■■ 4
SEMA4B-218ENST00000561085 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
SEMA4B-218ENST00000561085 SOGA1O94964 1423 aa39.97■■■■□ 3.99
SEMA4B-218ENST00000561085 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
SEMA4B-218ENST00000561085 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA4B-218ENST00000561085 TOP2BQ02880 1626 aa39.91■■■■□ 3.98
SEMA4B-218ENST00000561085 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.91■■■■□ 3.98
SEMA4B-218ENST00000561085 SYNJ1O43426 1573 aa39.89■■■■□ 3.98
SEMA4B-218ENST00000561085 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SEMA4B-218ENST00000561085 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.961e-7■■■■□ 22
SEMA4B-218ENST00000561085 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
SEMA4B-218ENST00000561085 WDR97A6NE52 1622 aa39.7■■■■□ 3.95
SEMA4B-218ENST00000561085 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.66■■■■□ 3.94
SEMA4B-218ENST00000561085 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.58■■■■□ 3.93
SEMA4B-218ENST00000561085 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.5■■■■□ 3.91
SEMA4B-218ENST00000561085 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.48■■■■□ 3.91
SEMA4B-218ENST00000561085 GRIN2BQ13224 1484 aa39.47■■■■□ 3.91
SEMA4B-218ENST00000561085 PBRM1Q86U86 1689 aa39.41■■■■□ 3.9
SEMA4B-218ENST00000561085 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.38■■■■□ 3.9
SEMA4B-218ENST00000561085 OSCARQ8IYS5 282 aa39.37■■■■□ 3.89
SEMA4B-218ENST00000561085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
SEMA4B-218ENST00000561085 CHD1O14646 1710 aa39.29■■■■□ 3.88
SEMA4B-218ENST00000561085 FBLN2P98095 1184 aa39.27■■■■□ 3.88
SEMA4B-218ENST00000561085 TRIM41Q8WV44 630 aa39.21■■■■□ 3.87
SEMA4B-218ENST00000561085 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
SEMA4B-218ENST00000561085 SYNJ2O15056 1496 aa39.19■■■■□ 3.86
SEMA4B-218ENST00000561085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
SEMA4B-218ENST00000561085 KIF27Q86VH2 1401 aa39.17■■■■□ 3.86
SEMA4B-218ENST00000561085 ADAMTS12P58397 1594 aa39.09■■■■□ 3.85
SEMA4B-218ENST00000561085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.05■■■■□ 3.84
SEMA4B-218ENST00000561085 IGF1RP08069 1367 aa39■■■■□ 3.83
SEMA4B-218ENST00000561085 GRIN2AQ12879 1464 aa38.96■■■■□ 3.83
SEMA4B-218ENST00000561085 CUL7Q14999 1698 aa38.87■■■■□ 3.81
SEMA4B-218ENST00000561085 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.87■■■■□ 3.81
SEMA4B-218ENST00000561085 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.84■■■■□ 3.81
SEMA4B-218ENST00000561085 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.84■■■■□ 3.81
SEMA4B-218ENST00000561085 NUP160Q12769 1436 aa38.78■■■■□ 3.8
SEMA4B-218ENST00000561085 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.77■■■■□ 3.8
SEMA4B-218ENST00000561085 CEP170Q5SW79 1584 aa38.75■■■■□ 3.79
SEMA4B-218ENST00000561085 ARHGEF11O15085 1522 aa38.68■■■■□ 3.78
SEMA4B-218ENST00000561085 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
SEMA4B-218ENST00000561085 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
SEMA4B-218ENST00000561085 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
SEMA4B-218ENST00000561085 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.55■■■■□ 3.76
SEMA4B-218ENST00000561085 EEA1Q15075 1411 aa38.53■■■■□ 3.76
SEMA4B-218ENST00000561085 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.49■■■■□ 3.75
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