RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558895.5

SEMA4B-206, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-206ENST00000558895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.7■■■■■ 7.15
SEMA4B-206ENST00000558895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.09■■■■■ 6.09
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCC9O60706 1549 aa52.07■■■■■ 5.93
SEMA4B-206ENST00000558895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.08■■■■■ 5.61
SEMA4B-206ENST00000558895 NACADO15069 1562 aa50.01■■■■■ 5.6
SEMA4B-206ENST00000558895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.01■■■■■ 5.6
SEMA4B-206ENST00000558895 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.7■■■■■ 5.55
SEMA4B-206ENST00000558895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.67■■■■■ 5.54
SEMA4B-206ENST00000558895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.42■■■■■ 5.5
SEMA4B-206ENST00000558895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.8■■■■■ 5.4
SEMA4B-206ENST00000558895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.68■■■■■ 5.38
SEMA4B-206ENST00000558895 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.49■■■■■ 5.35
SEMA4B-206ENST00000558895 SCRIBQ14160 1630 aa48.39■■■■■ 5.34
SEMA4B-206ENST00000558895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.09■■■■■ 5.29
SEMA4B-206ENST00000558895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.92■■■■■ 5.26
SEMA4B-206ENST00000558895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
SEMA4B-206ENST00000558895 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.08■■■■■ 5.13
SEMA4B-206ENST00000558895 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.83■■■■■ 5.09
SEMA4B-206ENST00000558895 SMARCA4P51532 1647 aa46.31■■■■■ 5
SEMA4B-206ENST00000558895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
SEMA4B-206ENST00000558895 NCAPD3P42695 1498 aa46.17■■■■■ 4.98
SEMA4B-206ENST00000558895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.13■■■■■ 4.98
SEMA4B-206ENST00000558895 SMARCA2P51531 1590 aa46.09■■■■■ 4.97
SEMA4B-206ENST00000558895 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.96■■■■■ 4.95
SEMA4B-206ENST00000558895 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.89■■■■■ 4.94
SEMA4B-206ENST00000558895 HMGXB3Q12766 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
SEMA4B-206ENST00000558895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
SEMA4B-206ENST00000558895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.87
SEMA4B-206ENST00000558895 WIZO95785 1651 aa45.44■■■■■ 4.86
SEMA4B-206ENST00000558895 NESP48681 1621 aa44.99■■■■■ 4.79
SEMA4B-206ENST00000558895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
SEMA4B-206ENST00000558895 ERCC6Q03468 1493 aa44.94■■■■■ 4.78
SEMA4B-206ENST00000558895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.94■■■■■ 4.78
SEMA4B-206ENST00000558895 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.82■■■■■ 4.77
SEMA4B-206ENST00000558895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.7■■■■■ 4.75
SEMA4B-206ENST00000558895 CUX2O14529 1486 aa44.53■■■■■ 4.72
SEMA4B-206ENST00000558895 CFTRP13569 1480 aa44.5■■■■■ 4.71
SEMA4B-206ENST00000558895 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.48■■■■■ 4.71
SEMA4B-206ENST00000558895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.42■■■■■ 4.7
SEMA4B-206ENST00000558895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
SEMA4B-206ENST00000558895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.27■■■■■ 4.68
SEMA4B-206ENST00000558895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
SEMA4B-206ENST00000558895 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.22■■■■■ 4.67
SEMA4B-206ENST00000558895 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.18■■■■■ 4.66
SEMA4B-206ENST00000558895 PRDM2Q13029 1718 aa44.06■■■■■ 4.64
SEMA4B-206ENST00000558895 WDR62O43379 1518 aa44.01■■■■■ 4.64
SEMA4B-206ENST00000558895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCC8Q09428 1581 aa43.62■■■■■ 4.57
SEMA4B-206ENST00000558895 TOPBP1Q92547 1522 aa43.53■■■■■ 4.56
SEMA4B-206ENST00000558895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.46■■■■■ 4.55
SEMA4B-206ENST00000558895 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.34■■■■■ 4.53
SEMA4B-206ENST00000558895 IFT140Q96RY7 1462 aa43.33■■■■■ 4.53
SEMA4B-206ENST00000558895 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
SEMA4B-206ENST00000558895 CUX1P39880 1505 aa43.12■■■■■ 4.49
SEMA4B-206ENST00000558895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.48
SEMA4B-206ENST00000558895 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
SEMA4B-206ENST00000558895 SOGA1O94964 1423 aa43.03■■■■■ 4.48
SEMA4B-206ENST00000558895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.02■■■■■ 4.48
SEMA4B-206ENST00000558895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.95■■■■■ 4.47
SEMA4B-206ENST00000558895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.87■■■■■ 4.45
SEMA4B-206ENST00000558895 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
SEMA4B-206ENST00000558895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.85■■■■■ 4.452e-8■■■□□ 16.9
SEMA4B-206ENST00000558895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
SEMA4B-206ENST00000558895 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
SEMA4B-206ENST00000558895 OSCARQ8IYS5 282 aa42.74■■■■■ 4.43
SEMA4B-206ENST00000558895 TOP2BQ02880 1626 aa42.74■■■■■ 4.43
SEMA4B-206ENST00000558895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.71■■■■■ 4.43
SEMA4B-206ENST00000558895 SYNJ1O43426 1573 aa42.68■■■■■ 4.42
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.63■■■■■ 4.42
SEMA4B-206ENST00000558895 GRIN2BQ13224 1484 aa42.53■■■■■ 4.4
SEMA4B-206ENST00000558895 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.51■■■■■ 4.4
SEMA4B-206ENST00000558895 FBLN2P98095 1184 aa42.43■■■■■ 4.38
SEMA4B-206ENST00000558895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.43■■■■■ 4.38
SEMA4B-206ENST00000558895 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.41■■■■■ 4.38
SEMA4B-206ENST00000558895 CHD1O14646 1710 aa42.33■■■■■ 4.37
SEMA4B-206ENST00000558895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
SEMA4B-206ENST00000558895 PBRM1Q86U86 1689 aa42.32■■■■■ 4.37
SEMA4B-206ENST00000558895 SYNJ2O15056 1496 aa42.25■■■■■ 4.35
SEMA4B-206ENST00000558895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.13■■■■■ 4.33
SEMA4B-206ENST00000558895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.03■■■■■ 4.32
SEMA4B-206ENST00000558895 KIF27Q86VH2 1401 aa42.02■■■■■ 4.32
SEMA4B-206ENST00000558895 ADAMTS12P58397 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
SEMA4B-206ENST00000558895 GRIN2AQ12879 1464 aa41.95■■■■■ 4.31
SEMA4B-206ENST00000558895 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.92■■■■■ 4.3
SEMA4B-206ENST00000558895 ARHGEF11O15085 1522 aa41.91■■■■■ 4.3
SEMA4B-206ENST00000558895 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
SEMA4B-206ENST00000558895 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
SEMA4B-206ENST00000558895 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
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SEMA4B-206ENST00000558895 TRIM41Q8WV44 630 aa41.84■■■■■ 4.29
SEMA4B-206ENST00000558895 NUP160Q12769 1436 aa41.78■■■■■ 4.28
SEMA4B-206ENST00000558895 CUL7Q14999 1698 aa41.69■■■■■ 4.26
SEMA4B-206ENST00000558895 CEP170Q5SW79 1584 aa41.69■■■■■ 4.26
SEMA4B-206ENST00000558895 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.62■■■■■ 4.25
SEMA4B-206ENST00000558895 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.62■■■■■ 4.25
SEMA4B-206ENST00000558895 ARAP1Q96P48 1450 aa41.55■■■■■ 4.24
SEMA4B-206ENST00000558895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.49■■■■■ 4.23
SEMA4B-206ENST00000558895 JPH4Q96JJ6 628 aa41.43■■■■■ 4.22
SEMA4B-206ENST00000558895 SHROOM2Q13796 1616 aa41.43■■■■■ 4.22
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