Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIGQ13278 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIGQ13278 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIGQ13278 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIGQ13278 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIGQ13278 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIGQ13278 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIGQ13278 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIGQ13278 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIGQ13278 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIGQ13278 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIGQ13278 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIGQ13278 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RIGQ13278 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIGQ13278 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIGQ13278 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIGQ13278 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIGQ13278 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIGQ13278 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIGQ13278 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIGQ13278 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIGQ13278 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIGQ13278 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIGQ13278 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIGQ13278 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIGQ13278 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIGQ13278 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIGQ13278 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIGQ13278 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIGQ13278 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIGQ13278 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIGQ13278 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIGQ13278 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIGQ13278 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIGQ13278 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIGQ13278 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIGQ13278 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIGQ13278 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIGQ13278 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIGQ13278 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIGQ13278 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIGQ13278 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIGQ13278 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIGQ13278 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIGQ13278 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIGQ13278 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIGQ13278 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIGQ13278 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIGQ13278 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIGQ13278 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIGQ13278 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIGQ13278 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIGQ13278 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIGQ13278 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIGQ13278 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIGQ13278 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIGQ13278 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIGQ13278 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIGQ13278 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIGQ13278 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIGQ13278 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIGQ13278 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIGQ13278 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIGQ13278 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIGQ13278 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIGQ13278 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIGQ13278 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIGQ13278 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIGQ13278 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIGQ13278 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIGQ13278 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIGQ13278 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIGQ13278 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIGQ13278 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIGQ13278 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIGQ13278 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIGQ13278 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIGQ13278 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIGQ13278 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIGQ13278 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIGQ13278 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIGQ13278 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIGQ13278 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIGQ13278 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIGQ13278 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIGQ13278 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIGQ13278 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIGQ13278 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIGQ13278 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIGQ13278 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIGQ13278 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIGQ13278 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIGQ13278 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIGQ13278 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIGQ13278 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIGQ13278 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIGQ13278 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIGQ13278 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIGQ13278 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIGQ13278 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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