Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CACNA1BQ00975 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNA1BQ00975 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CACNA1BQ00975 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNA1BQ00975 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CACNA1BQ00975 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CACNA1BQ00975 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CACNA1BQ00975 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CACNA1BQ00975 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNA1BQ00975 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNA1BQ00975 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNA1BQ00975 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CACNA1BQ00975 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CACNA1BQ00975 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CACNA1BQ00975 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA1BQ00975 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA1BQ00975 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNA1BQ00975 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CACNA1BQ00975 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1BQ00975 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA1BQ00975 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1BQ00975 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1BQ00975 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1BQ00975 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA1BQ00975 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA1BQ00975 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA1BQ00975 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA1BQ00975 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CACNA1BQ00975 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1BQ00975 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CACNA1BQ00975 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1BQ00975 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CACNA1BQ00975 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1BQ00975 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNA1BQ00975 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNA1BQ00975 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1BQ00975 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1BQ00975 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNA1BQ00975 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1BQ00975 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNA1BQ00975 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1BQ00975 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1BQ00975 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1BQ00975 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1BQ00975 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1BQ00975 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNA1BQ00975 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNA1BQ00975 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1BQ00975 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA1BQ00975 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA1BQ00975 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1BQ00975 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA1BQ00975 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CACNA1BQ00975 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1BQ00975 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA1BQ00975 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1BQ00975 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1BQ00975 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1BQ00975 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1BQ00975 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA1BQ00975 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1BQ00975 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA1BQ00975 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1BQ00975 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1BQ00975 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1BQ00975 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CACNA1BQ00975 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA1BQ00975 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1BQ00975 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1BQ00975 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1BQ00975 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1BQ00975 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNA1BQ00975 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1BQ00975 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA1BQ00975 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1BQ00975 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1BQ00975 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1BQ00975 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1BQ00975 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1BQ00975 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1BQ00975 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1BQ00975 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1BQ00975 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1BQ00975 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1BQ00975 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1BQ00975 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1BQ00975 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1BQ00975 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1BQ00975 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1BQ00975 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1BQ00975 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1BQ00975 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA1BQ00975 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1BQ00975 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms