Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STX1BP61266 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STX1BP61266 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
STX1BP61266 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
STX1BP61266 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
STX1BP61266 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
STX1BP61266 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
STX1BP61266 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
STX1BP61266 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
STX1BP61266 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
STX1BP61266 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
STX1BP61266 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
STX1BP61266 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
STX1BP61266 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
STX1BP61266 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
STX1BP61266 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
STX1BP61266 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
STX1BP61266 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STX1BP61266 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STX1BP61266 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STX1BP61266 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
STX1BP61266 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
STX1BP61266 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STX1BP61266 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
STX1BP61266 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STX1BP61266 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STX1BP61266 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STX1BP61266 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STX1BP61266 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STX1BP61266 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
STX1BP61266 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1BP61266 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STX1BP61266 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX1BP61266 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STX1BP61266 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX1BP61266 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STX1BP61266 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX1BP61266 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX1BP61266 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX1BP61266 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX1BP61266 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX1BP61266 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX1BP61266 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STX1BP61266 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX1BP61266 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX1BP61266 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STX1BP61266 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STX1BP61266 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STX1BP61266 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX1BP61266 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STX1BP61266 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX1BP61266 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX1BP61266 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX1BP61266 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX1BP61266 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX1BP61266 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX1BP61266 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1BP61266 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX1BP61266 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX1BP61266 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX1BP61266 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX1BP61266 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX1BP61266 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1BP61266 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX1BP61266 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX1BP61266 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX1BP61266 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX1BP61266 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
STX1BP61266 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX1BP61266 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX1BP61266 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX1BP61266 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX1BP61266 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX1BP61266 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX1BP61266 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX1BP61266 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX1BP61266 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX1BP61266 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX1BP61266 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX1BP61266 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1BP61266 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1BP61266 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1BP61266 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STX1BP61266 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STX1BP61266 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX1BP61266 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX1BP61266 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX1BP61266 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STX1BP61266 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX1BP61266 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX1BP61266 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX1BP61266 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX1BP61266 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX1BP61266 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX1BP61266 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX1BP61266 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STX1BP61266 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX1BP61266 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX1BP61266 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX1BP61266 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms