Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC52.82■■■■■ 6.05
NESP48681 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC52.78■■■■■ 6.04
NESP48681 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
NESP48681 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
NESP48681 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
NESP48681 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
NESP48681 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
NESP48681 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
NESP48681 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC52.57■■■■■ 6.01
NESP48681 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
NESP48681 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC52.51■■■■■ 6
NESP48681 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
NESP48681 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC52.45■■■■■ 5.99
NESP48681 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC52.39■■■■■ 5.98
NESP48681 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC52.38■■■■■ 5.98
NESP48681 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
NESP48681 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC52.16■■■■■ 5.94
NESP48681 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
NESP48681 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC52.07■■■■■ 5.93
NESP48681 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
NESP48681 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.05■■■■■ 5.92
NESP48681 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC52.03■■■■■ 5.92
NESP48681 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.01■■■■■ 5.92
NESP48681 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
NESP48681 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
NESP48681 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC51.93■■■■■ 5.9
NESP48681 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
NESP48681 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.87■■■■■ 5.89
NESP48681 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
NESP48681 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
NESP48681 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
NESP48681 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
NESP48681 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
NESP48681 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC51.71■■■■■ 5.87
NESP48681 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
NESP48681 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
NESP48681 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC51.67■■■■■ 5.86
NESP48681 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC51.64■■■■■ 5.86
NESP48681 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC51.6■■■■■ 5.85
NESP48681 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC51.57■■■■■ 5.85
NESP48681 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC51.57■■■■■ 5.85
NESP48681 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.85
NESP48681 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC51.55■■■■■ 5.84
NESP48681 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
NESP48681 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC51.49■■■■■ 5.83
NESP48681 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC51.49■■■■■ 5.83
NESP48681 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
NESP48681 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC51.45■■■■■ 5.83
NESP48681 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC51.41■■■■■ 5.82
NESP48681 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
NESP48681 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC51.31■■■■■ 5.8
NESP48681 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
NESP48681 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
NESP48681 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NESP48681 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
NESP48681 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NESP48681 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NESP48681 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NESP48681 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
NESP48681 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC51.2■■■■■ 5.79
NESP48681 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.2■■■■■ 5.79
NESP48681 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
NESP48681 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NESP48681 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NESP48681 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NESP48681 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
NESP48681 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
NESP48681 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
NESP48681 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC50.96■■■■■ 5.75
NESP48681 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
NESP48681 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
NESP48681 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.87■■■■■ 5.73
NESP48681 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
NESP48681 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC50.84■■■■■ 5.73
NESP48681 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
NESP48681 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
NESP48681 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
NESP48681 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
NESP48681 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
NESP48681 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC50.76■■■■■ 5.72
NESP48681 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC50.76■■■■■ 5.72
NESP48681 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
NESP48681 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
NESP48681 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NESP48681 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NESP48681 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NESP48681 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NESP48681 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NESP48681 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
NESP48681 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC50.66■■■■■ 5.7
NESP48681 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NESP48681 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
NESP48681 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NESP48681 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC50.58■■■■■ 5.69
NESP48681 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
NESP48681 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
NESP48681 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC50.42■■■■■ 5.66
NESP48681 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
NESP48681 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.41■■■■■ 5.66
NESP48681 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms