Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
NESP48681 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC50.34■■■■■ 5.65
NESP48681 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
NESP48681 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
NESP48681 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
NESP48681 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.64
NESP48681 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC50.29■■■■■ 5.64
NESP48681 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC50.25■■■■■ 5.64
NESP48681 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC50.25■■■■■ 5.63
NESP48681 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
NESP48681 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NESP48681 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC50.2■■■■■ 5.63
NESP48681 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC50.2■■■■■ 5.63
NESP48681 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NESP48681 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
NESP48681 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
NESP48681 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC50.1■■■■■ 5.61
NESP48681 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC50.1■■■■■ 5.61
NESP48681 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
NESP48681 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
NESP48681 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.07■■■■■ 5.61
NESP48681 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
NESP48681 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
NESP48681 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC50.01■■■■■ 5.6
NESP48681 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
NESP48681 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50■■■■■ 5.6
NESP48681 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
NESP48681 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
NESP48681 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
NESP48681 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
NESP48681 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NESP48681 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
NESP48681 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NESP48681 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC49.85■■■■■ 5.57
NESP48681 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.84■■■■■ 5.57
NESP48681 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NESP48681 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NESP48681 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC49.79■■■■■ 5.56
NESP48681 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
NESP48681 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NESP48681 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
NESP48681 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
NESP48681 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NESP48681 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NESP48681 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC49.71■■■■■ 5.55
NESP48681 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
NESP48681 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC49.71■■■■■ 5.55
NESP48681 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
NESP48681 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
NESP48681 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
NESP48681 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC49.69■■■■■ 5.55
NESP48681 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC49.69■■■■■ 5.55
NESP48681 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
NESP48681 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.68■■■■■ 5.54
NESP48681 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NESP48681 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
NESP48681 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
NESP48681 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC49.63■■■■■ 5.53
NESP48681 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NESP48681 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
NESP48681 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
NESP48681 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
NESP48681 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC49.5■■■■■ 5.51
NESP48681 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC49.49■■■■■ 5.51
NESP48681 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
NESP48681 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
NESP48681 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC49.47■■■■■ 5.51
NESP48681 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
NESP48681 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
NESP48681 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
NESP48681 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
NESP48681 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
NESP48681 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
NESP48681 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC49.39■■■■■ 5.5
NESP48681 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
NESP48681 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
NESP48681 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
NESP48681 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.49
NESP48681 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC49.34■■■■■ 5.49
NESP48681 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
NESP48681 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NESP48681 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
NESP48681 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NESP48681 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NESP48681 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
NESP48681 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
NESP48681 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
NESP48681 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
NESP48681 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
NESP48681 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC49.16■■■■■ 5.46
NESP48681 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
NESP48681 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
NESP48681 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.12■■■■■ 5.45
NESP48681 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
NESP48681 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
NESP48681 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
NESP48681 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
NESP48681 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC49.06■■■■■ 5.44
NESP48681 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
NESP48681 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC48.99■■■■■ 5.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms