Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HOXD11P31277 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HOXD11P31277 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HOXD11P31277 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HOXD11P31277 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HOXD11P31277 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HOXD11P31277 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
HOXD11P31277 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXD11P31277 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HOXD11P31277 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HOXD11P31277 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HOXD11P31277 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HOXD11P31277 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
HOXD11P31277 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXD11P31277 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXD11P31277 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXD11P31277 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXD11P31277 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
HOXD11P31277 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HOXD11P31277 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXD11P31277 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXD11P31277 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HOXD11P31277 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXD11P31277 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXD11P31277 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXD11P31277 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXD11P31277 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXD11P31277 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXD11P31277 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HOXD11P31277 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HOXD11P31277 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HOXD11P31277 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXD11P31277 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HOXD11P31277 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXD11P31277 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXD11P31277 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXD11P31277 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXD11P31277 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXD11P31277 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXD11P31277 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXD11P31277 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXD11P31277 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HOXD11P31277 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXD11P31277 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXD11P31277 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXD11P31277 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXD11P31277 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXD11P31277 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXD11P31277 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXD11P31277 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXD11P31277 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXD11P31277 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXD11P31277 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXD11P31277 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXD11P31277 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXD11P31277 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXD11P31277 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXD11P31277 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXD11P31277 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXD11P31277 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXD11P31277 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXD11P31277 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HOXD11P31277 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HOXD11P31277 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HOXD11P31277 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXD11P31277 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXD11P31277 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXD11P31277 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXD11P31277 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms