Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SYT1P21579 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SYT1P21579 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SYT1P21579 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
SYT1P21579 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYT1P21579 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYT1P21579 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYT1P21579 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYT1P21579 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYT1P21579 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYT1P21579 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYT1P21579 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYT1P21579 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYT1P21579 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYT1P21579 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYT1P21579 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYT1P21579 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYT1P21579 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYT1P21579 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYT1P21579 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYT1P21579 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYT1P21579 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYT1P21579 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SYT1P21579 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYT1P21579 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYT1P21579 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYT1P21579 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYT1P21579 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYT1P21579 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYT1P21579 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYT1P21579 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SYT1P21579 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYT1P21579 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYT1P21579 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYT1P21579 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYT1P21579 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYT1P21579 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYT1P21579 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYT1P21579 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYT1P21579 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYT1P21579 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYT1P21579 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYT1P21579 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYT1P21579 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYT1P21579 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYT1P21579 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SYT1P21579 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SYT1P21579 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYT1P21579 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYT1P21579 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYT1P21579 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYT1P21579 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYT1P21579 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYT1P21579 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYT1P21579 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYT1P21579 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYT1P21579 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SYT1P21579 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYT1P21579 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYT1P21579 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYT1P21579 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYT1P21579 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYT1P21579 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYT1P21579 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYT1P21579 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYT1P21579 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYT1P21579 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYT1P21579 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYT1P21579 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYT1P21579 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYT1P21579 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYT1P21579 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYT1P21579 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYT1P21579 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT1P21579 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT1P21579 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT1P21579 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYT1P21579 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYT1P21579 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYT1P21579 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYT1P21579 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYT1P21579 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYT1P21579 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYT1P21579 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYT1P21579 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYT1P21579 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SYT1P21579 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYT1P21579 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYT1P21579 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYT1P21579 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYT1P21579 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYT1P21579 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYT1P21579 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYT1P21579 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SYT1P21579 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYT1P21579 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYT1P21579 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYT1P21579 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYT1P21579 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYT1P21579 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms