Protein–RNA interactions for Protein: P04437

TCRA, T-cell receptor alpha chain V region CTL-L17, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRAP04437 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRAP04437 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRAP04437 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRAP04437 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRAP04437 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRAP04437 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRAP04437 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRAP04437 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRAP04437 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRAP04437 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRAP04437 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRAP04437 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRAP04437 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCRAP04437 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCRAP04437 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRAP04437 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRAP04437 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRAP04437 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCRAP04437 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRAP04437 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRAP04437 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRAP04437 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCRAP04437 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRAP04437 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCRAP04437 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCRAP04437 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCRAP04437 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRAP04437 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRAP04437 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRAP04437 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCRAP04437 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRAP04437 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRAP04437 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRAP04437 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRAP04437 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRAP04437 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRAP04437 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRAP04437 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRAP04437 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRAP04437 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRAP04437 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRAP04437 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRAP04437 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRAP04437 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRAP04437 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRAP04437 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRAP04437 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRAP04437 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRAP04437 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRAP04437 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRAP04437 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRAP04437 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRAP04437 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRAP04437 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRAP04437 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRAP04437 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRAP04437 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRAP04437 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRAP04437 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRAP04437 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRAP04437 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRAP04437 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRAP04437 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRAP04437 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRAP04437 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRAP04437 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRAP04437 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRAP04437 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRAP04437 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRAP04437 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRAP04437 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRAP04437 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCRAP04437 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRAP04437 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRAP04437 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRAP04437 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRAP04437 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRAP04437 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRAP04437 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRAP04437 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRAP04437 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRAP04437 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRAP04437 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRAP04437 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRAP04437 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRAP04437 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRAP04437 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRAP04437 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRAP04437 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCRAP04437 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRAP04437 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRAP04437 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRAP04437 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRAP04437 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRAP04437 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRAP04437 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRAP04437 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRAP04437 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRAP04437 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCRAP04437 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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