Protein–RNA interactions for Protein: O95158

NXPH4, Neurexophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH4O95158 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH4O95158 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPH4O95158 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPH4O95158 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPH4O95158 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPH4O95158 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXPH4O95158 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPH4O95158 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXPH4O95158 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH4O95158 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPH4O95158 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPH4O95158 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPH4O95158 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPH4O95158 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPH4O95158 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPH4O95158 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPH4O95158 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPH4O95158 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPH4O95158 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPH4O95158 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPH4O95158 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPH4O95158 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPH4O95158 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPH4O95158 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH4O95158 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH4O95158 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPH4O95158 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPH4O95158 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPH4O95158 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXPH4O95158 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXPH4O95158 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPH4O95158 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH4O95158 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH4O95158 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH4O95158 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH4O95158 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH4O95158 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH4O95158 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPH4O95158 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPH4O95158 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPH4O95158 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXPH4O95158 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXPH4O95158 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXPH4O95158 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXPH4O95158 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPH4O95158 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPH4O95158 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPH4O95158 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPH4O95158 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPH4O95158 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPH4O95158 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPH4O95158 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPH4O95158 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPH4O95158 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPH4O95158 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPH4O95158 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPH4O95158 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPH4O95158 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPH4O95158 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPH4O95158 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPH4O95158 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPH4O95158 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPH4O95158 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPH4O95158 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPH4O95158 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPH4O95158 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPH4O95158 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPH4O95158 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPH4O95158 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPH4O95158 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPH4O95158 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPH4O95158 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPH4O95158 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPH4O95158 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPH4O95158 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXPH4O95158 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXPH4O95158 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXPH4O95158 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXPH4O95158 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXPH4O95158 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXPH4O95158 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXPH4O95158 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXPH4O95158 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms