Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S9

IGKV1D-37, Immunoglobulin kappa variable 1-37 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-37A0A075B6S9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGKV1D-37A0A075B6S9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGKV1D-37A0A075B6S9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGKV1D-37A0A075B6S9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGKV1D-37A0A075B6S9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGKV1D-37A0A075B6S9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGKV1D-37A0A075B6S9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGKV1D-37A0A075B6S9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV1D-37A0A075B6S9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGKV1D-37A0A075B6S9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGKV1D-37A0A075B6S9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGKV1D-37A0A075B6S9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGKV1D-37A0A075B6S9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGKV1D-37A0A075B6S9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV1D-37A0A075B6S9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV1D-37A0A075B6S9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1D-37A0A075B6S9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1D-37A0A075B6S9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV1D-37A0A075B6S9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-37A0A075B6S9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV1D-37A0A075B6S9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-37A0A075B6S9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-37A0A075B6S9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV1D-37A0A075B6S9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV1D-37A0A075B6S9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV1D-37A0A075B6S9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV1D-37A0A075B6S9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGKV1D-37A0A075B6S9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1D-37A0A075B6S9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV1D-37A0A075B6S9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV1D-37A0A075B6S9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1D-37A0A075B6S9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV1D-37A0A075B6S9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGKV1D-37A0A075B6S9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGKV1D-37A0A075B6S9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGKV1D-37A0A075B6S9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV1D-37A0A075B6S9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV1D-37A0A075B6S9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-37A0A075B6S9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV1D-37A0A075B6S9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGKV1D-37A0A075B6S9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-37A0A075B6S9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-37A0A075B6S9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-37A0A075B6S9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1D-37A0A075B6S9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV1D-37A0A075B6S9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1D-37A0A075B6S9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1D-37A0A075B6S9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1D-37A0A075B6S9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1D-37A0A075B6S9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV1D-37A0A075B6S9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV1D-37A0A075B6S9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1D-37A0A075B6S9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1D-37A0A075B6S9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV1D-37A0A075B6S9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV1D-37A0A075B6S9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1D-37A0A075B6S9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1D-37A0A075B6S9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1D-37A0A075B6S9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1D-37A0A075B6S9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1D-37A0A075B6S9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGKV1D-37A0A075B6S9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-37A0A075B6S9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1D-37A0A075B6S9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-37A0A075B6S9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-37A0A075B6S9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-37A0A075B6S9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-37A0A075B6S9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-37A0A075B6S9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-37A0A075B6S9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-37A0A075B6S9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-37A0A075B6S9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-37A0A075B6S9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1D-37A0A075B6S9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV1D-37A0A075B6S9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1D-37A0A075B6S9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1D-37A0A075B6S9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1D-37A0A075B6S9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1D-37A0A075B6S9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV1D-37A0A075B6S9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV1D-37A0A075B6S9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1D-37A0A075B6S9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1D-37A0A075B6S9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1D-37A0A075B6S9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms