Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYVE1Q9Y5Y7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYVE1Q9Y5Y7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYVE1Q9Y5Y7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms