Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNPO2Q9UMS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNPO2Q9UMS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNPO2Q9UMS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNPO2Q9UMS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms