Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH9Q9ULB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH9Q9ULB4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH9Q9ULB4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH9Q9ULB4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms