Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC42EP3Q9UKI2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC42EP3Q9UKI2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms