Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3BQ9UH17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3BQ9UH17 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3BQ9UH17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms