Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRHL1Q9NZI5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRHL1Q9NZI5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRHL1Q9NZI5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRHL1Q9NZI5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRHL1Q9NZI5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL1Q9NZI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRHL1Q9NZI5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRHL1Q9NZI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms