Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL28Q9NXS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL28Q9NXS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms