Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFCQ9NRA1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDGFCQ9NRA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDGFCQ9NRA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFCQ9NRA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFCQ9NRA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms