Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS4Q9NQG7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPS4Q9NQG7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS4Q9NQG7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms