Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1BQ9NQG5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPRD1BQ9NQG5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms