Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO1B3Q9NPD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLCO1B3Q9NPD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO1B3Q9NPD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms